在R中是否有衡量函数执行时间的标准化方法?
显然我可以用系统。时间，然后取它们的差异，但我想知道是否有一些标准化的方法或功能(不想发明轮子)。
我似乎记得我曾经用过如下的东西:
somesysfunction("myfunction(with,arguments)")
> Start time : 2001-01-01 00:00:00 # output of somesysfunction
> "Result" "of" "myfunction" # output of myfunction
> End time : 2001-01-01 00:00:10 # output of somesysfunction
> Total Execution time : 10 seconds # output of somesysfunction
当前回答
如果你喜欢，你可以使用matlab风格的tic-toc函数。看另一个SO问题
秒表功能在R
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library(rbenchmark)
sleep_func <- function() { Sys.sleep(0.5) }
benchmark(sleep_func())
out:
test replications elapsed relative user.self sys.self user.child sys.child
1 sleep_func() 100 50.08 1 0.02 0 NA NA
microbenchmark是一个轻量级(约50kB)包，或多或少是R中对多个表达式和函数进行基准测试的标准方法:
microbenchmark(myfunction(with,arguments))
例如:
> microbenchmark::microbenchmark(log10(5), log(5)/log(10), times = 10000)
Unit: nanoseconds
expr min lq mean median uq max neval cld
log10(5) 0 0 25.5738 0 1 10265 10000 a
log(5)/log(10) 0 0 28.1838 0 1 10265 10000
在这里，两个表达式都被计算了10000次，平均执行时间约为25-30纳秒。
度量执行时间的一个稍微好一点的方法是使用rbenchmark包。这个包(很容易)允许您指定复制测试的次数，以及相对基准测试应该是多少次。
另见stats.stackexchange上的相关问题
包“tictoc”为您提供了一种非常简单的测量执行时间的方法。文档在:https://cran.fhcrc.org/web/packages/tictoc/tictoc.pdf。
install.packages("tictoc")
require(tictoc)
tic()
rnorm(1000,0,1)
toc()
要保存经过的时间到一个变量，你可以这样做:
install.packages("tictoc")
require(tictoc)
tic()
rnorm(1000,0,1)
exectime <- toc()
exectime <- exectime$toc - exectime$tic
正如Andrie所说，system.time()工作正常。对于短函数，我更喜欢在其中放入replication ():
system.time( replicate(10000, myfunction(with,arguments) ) )
