在R中是否有衡量函数执行时间的标准化方法?

显然我可以用系统。时间,然后取它们的差异,但我想知道是否有一些标准化的方法或功能(不想发明轮子)。


我似乎记得我曾经用过如下的东西:

somesysfunction("myfunction(with,arguments)")
> Start time : 2001-01-01 00:00:00  # output of somesysfunction
> "Result" "of" "myfunction"        # output of myfunction
> End time : 2001-01-01 00:00:10    # output of somesysfunction
> Total Execution time : 10 seconds # output of somesysfunction

当前回答

library(rbenchmark)

sleep_func <- function() { Sys.sleep(0.5) }

benchmark(sleep_func())

out:

 test replications elapsed relative user.self sys.self user.child sys.child

1 sleep_func()          100   50.08        1      0.02        0         NA        NA

其他回答

您可以使用Sys.time()。但是,当您在表格或csv文件中记录时差时,不能简单地使用end - start。相反,你应该定义这个单位:

f_name <- function (args*){
start <- Sys.time()
""" You codes here """
end <- Sys.time()
total_time <- as.numeric (end - start, units = "mins") # or secs ... 
}

然后你可以使用total_time,它有一个合适的格式。

另一种可能的方法是使用Sys.time():

start.time <- Sys.time()
...Relevent codes...
end.time <- Sys.time()
time.taken <- end.time - start.time
time.taken

与上面的答案相比,这不是最优雅的方法,但绝对是一种方法。

内置函数system.time()将执行此操作。

使用like: system。Time (result <- myfunction(with, arguments))

包“tictoc”为您提供了一种非常简单的测量执行时间的方法。文档在:https://cran.fhcrc.org/web/packages/tictoc/tictoc.pdf。

install.packages("tictoc")
require(tictoc)
tic()
rnorm(1000,0,1)
toc()

要保存经过的时间到一个变量,你可以这样做:

install.packages("tictoc")
require(tictoc)
tic()
rnorm(1000,0,1)
exectime <- toc()
exectime <- exectime$toc - exectime$tic

度量执行时间的一个稍微好一点的方法是使用rbenchmark包。这个包(很容易)允许您指定复制测试的次数,以及相对基准测试应该是多少次。

另见stats.stackexchange上的相关问题