将BOM放在UTF-8编码的文件中至少有三个问题。

不包含文本的文件不再为空，因为它们始终包含BOM。 在UTF-8的ASCII子集中保存文本的文件本身不再是ASCII，因为BOM不是ASCII，这使得一些现有工具无法使用，用户可能不可能替换这些遗留工具。 不可能将几个文件连接在一起，因为现在每个文件开头都有一个BOM。

而且，正如其他人所提到的，使用BOM来检测某些东西是否是UTF-8是既不够也没有必要的:

这是不够的，因为任意字节序列可能恰好以构成BOM的确切序列开始。 这是不必要的，因为你可以像读取UTF-8一样读取字节;如果成功，根据定义，它是有效的UTF-8。

BOM倾向于在某个地方爆炸(没有双关语)。当它突然出现时(例如，无法被浏览器、编辑器等识别)，它会以奇怪的字符出现在文档的开头(例如，HTML文件、JSON响应、RSS等)，并导致类似于最近奥巴马在Twitter上谈话时经历的编码问题那样的尴尬。

当它出现在难以调试的地方或当测试被忽略时，这是非常令人讨厌的。所以除非必须使用，否则最好避免使用。

以下是我使用Visual Studio、Sourcetree和Bitbucket拉请求的经验，这给了我一些问题:

因此，在审查拉取请求时，带有签名的BOM将在每个文件上包含一个红点字符(这可能非常烦人)。

如果你把鼠标停在上面，它会显示一个像“ufeff”这样的字符，但事实证明Sourcetree不显示这些类型的字节标记，所以它很可能会在你的拉请求中结束，这应该是可以的，因为这是Visual Studio 2017现在编码新文件的方式，所以也许Bitbucket应该忽略这个或让它以另一种方式显示，更多信息在这里:

红点标记BitBucket差异视图

应该注意的是，对于某些文件，即使在Windows上也不能有BOM。例如SQL*plus或VBScript文件。如果这样的文件包含BOM，则在尝试执行它们时会出现错误。

引用于维基百科页面底部BOM: http://en.wikipedia.org/wiki/Byte-order_mark#cite_note-2

对于UTF-8，使用BOM既不要求也不推荐，但在从使用BOM的其他编码形式转换UTF-8数据或将BOM用作UTF-8签名的上下文中可能会遇到这种情况。

问:UTF-8和没有BOM的UTF-8有什么不同?哪个更好?

以下是一些摘自维基百科关于字节顺序标记(BOM)的文章，我相信这些文章为这个问题提供了一个可靠的答案。

关于BOM和UTF-8的含义:

Unicode标准允许使用UTF-8格式的BOM，但不要求 或推荐使用。字节顺序在UTF-8中没有意义，因此 在UTF-8中唯一使用的是在文本流开始时发出信号 以UTF-8编码。

不使用BOM的参数:

不使用BOM的主要动机是向后兼容性 使用不支持unicode的软件…另一个不这样做的原因 使用BOM是为了鼓励UTF-8作为“默认”编码。

使用BOM的参数:

The argument for using a BOM is that without it, heuristic analysis is required to determine what character encoding a file is using. Historically such analysis, to distinguish various 8-bit encodings, is complicated, error-prone, and sometimes slow. A number of libraries are available to ease the task, such as Mozilla Universal Charset Detector and International Components for Unicode. Programmers mistakenly assume that detection of UTF-8 is equally difficult (it is not because of the vast majority of byte sequences are invalid UTF-8, while the encodings these libraries are trying to distinguish allow all possible byte sequences). Therefore not all Unicode-aware programs perform such an analysis and instead rely on the BOM. In particular, Microsoft compilers and interpreters, and many pieces of software on Microsoft Windows such as Notepad will not correctly read UTF-8 text unless it has only ASCII characters or it starts with the BOM, and will add a BOM to the start when saving text as UTF-8. Google Docs will add a BOM when a Microsoft Word document is downloaded as a plain text file.

有或没有BOM，哪个更好:

IETF建议，如果一个协议(a)总是使用UTF-8， 或者(b)有其他方式表明使用的是什么编码， 那么它“应该禁止使用U+FEFF作为签名。”

我的结论是:

仅在与软件应用程序的兼容性是绝对必要的情况下使用BOM。

还要注意，虽然引用的维基百科文章指出，许多Microsoft应用程序依赖BOM来正确检测UTF-8，但并非所有Microsoft应用程序都是如此。例如，正如@barlop所指出的，当使用带有UTF-8†的Windows命令提示符时，此类类型和更多的命令不期望出现BOM。如果存在BOM，它可能会像其他应用程序一样出现问题。

†chcp命令通过代码页65001提供对UTF-8(没有BOM)的支持。