如果您希望保留第二个存储库的确切提交历史，并因此保留将来轻松合并上游更改的能力，那么下面是您想要的方法。它会导致子树的未修改历史被导入到repo中，再加上一个合并提交，将合并的存储库移动到子目录中。

git remote add XXX_remote <path-or-url-to-XXX-repo>
git fetch XXX_remote
git merge -s ours --no-commit --allow-unrelated-histories XXX_remote/master
git read-tree --prefix=ZZZ/ -u XXX_remote/master
git commit -m "Imported XXX as a subtree."

你可以像这样跟踪上游的变化:

git pull -s subtree XXX_remote master

在进行合并之前，Git会自己计算出根的位置，因此您不需要在后续的合并中指定前缀。

缺点是在合并的历史中文件没有前缀(不在子目录中)。因此，git log ZZZ/a会显示除了合并历史之外的所有更改(如果有的话)。你可以:

git log --follow -- a

但这不会显示合并历史中其他的变化。

换句话说，如果不更改存储库XXX中的ZZZ文件，则需要指定——follow和一个无前缀路径。如果在两个存储库中都更改它们，则有两个命令，其中没有一个显示所有更改。

2.9之前的Git版本:你不需要给Git merge传递——allow-unrelated-histories选项。

另一个答案中的方法使用read-tree并跳过merge -s ours步骤，实际上与使用cp复制文件并提交结果没有什么不同。

原始来源来自github的“子树合并”帮助文章。这是另一个有用的链接。

Git-subtree正是为这样的用例设计的脚本:将多个存储库合并为一个，同时保留历史(和/或分割子树的历史，尽管这似乎与这个问题无关)。从1.7.11版开始，它作为git树的一部分发布。

要合并一个<repo> at revision <rev> as subdirectory <prefix>的仓库，使用git子树add，如下所示:

git subtree add -P <prefix> <repo> <rev>

Git-subtree以一种更用户友好的方式实现子树合并策略。

对于您的情况，在存储库YYY中，您将运行:

git subtree add -P ZZZ /path/to/XXX.git master

缺点是在合并的历史中文件没有前缀(不在子目录中)。因此，git log ZZZ/a会显示除了合并历史之外的所有更改(如果有的话)。你可以:

git log --follow -- a

但这不会显示合并历史中其他的变化。

换句话说，如果不更改存储库XXX中的ZZZ文件，则需要指定——follow和一个无前缀路径。如果在两个存储库中都更改它们，则有两个命令，其中没有一个显示所有更改。

这里有更多。

我认为你可以使用'git mv'和'git pull'来做到这一点。

我是一个公平的git新手-所以要小心你的主存储库-但我刚刚在一个临时目录中尝试了这一点，它似乎工作。

首先-重命名XXX的结构，以匹配你想要它在YYY中的样子:

cd XXX
mkdir tmp
git mv ZZZ tmp/ZZZ
git mv tmp ZZZ

现在XXX是这样的:

XXX
 |- ZZZ
     |- ZZZ

现在使用'git pull'来获取更改:

cd ../YYY
git pull ../XXX

现在YYY是这样的:

YYY
 |- ZZZ
     |- ZZZ
 |- (other folders that already were in YYY)

Git仓库本身就有一个著名的实例，在Git社区中被统称为“有史以来最酷的合并”(以Linus Torvalds在给Git邮件列表中描述这次合并的电子邮件的主题行命名)。在这种情况下，gitk Git GUI现在是Git的一部分，实际上曾经是一个单独的项目。Linus设法将该存储库合并到Git存储库中

它出现在Git存储库中，就好像它一直是作为Git的一部分开发的一样， 所有的历史都保存完好 它仍然可以在旧的存储库中独立开发，只需通过git提取更改即可。

电子邮件包含了复制所需的步骤，但不适合胆小的人:首先，Linus写了Git，所以他可能比你我知道得多一些;其次，这是近5年前的事情了，Git从那时起已经有了很大的改进，所以现在可能要容易得多。

特别是，我猜现在人们会在这种特定情况下使用gitk子模块。

如果您希望保留第二个存储库的确切提交历史，并因此保留将来轻松合并上游更改的能力，那么下面是您想要的方法。它会导致子树的未修改历史被导入到repo中，再加上一个合并提交，将合并的存储库移动到子目录中。

git remote add XXX_remote <path-or-url-to-XXX-repo>
git fetch XXX_remote
git merge -s ours --no-commit --allow-unrelated-histories XXX_remote/master
git read-tree --prefix=ZZZ/ -u XXX_remote/master
git commit -m "Imported XXX as a subtree."

你可以像这样跟踪上游的变化:

git pull -s subtree XXX_remote master

在进行合并之前，Git会自己计算出根的位置，因此您不需要在后续的合并中指定前缀。

缺点是在合并的历史中文件没有前缀(不在子目录中)。因此，git log ZZZ/a会显示除了合并历史之外的所有更改(如果有的话)。你可以:

git log --follow -- a

但这不会显示合并历史中其他的变化。

换句话说，如果不更改存储库XXX中的ZZZ文件，则需要指定——follow和一个无前缀路径。如果在两个存储库中都更改它们，则有两个命令，其中没有一个显示所有更改。

2.9之前的Git版本:你不需要给Git merge传递——allow-unrelated-histories选项。

另一个答案中的方法使用read-tree并跳过merge -s ours步骤，实际上与使用cp复制文件并提交结果没有什么不同。

原始来源来自github的“子树合并”帮助文章。这是另一个有用的链接。

我当时在找-s他们的，当然，这个策略不存在。我的历史是我在GitHub上分叉了一个项目，现在由于某种原因，我的本地master不能与上游/master合并，尽管我没有对这个分支做任何本地更改。(真的不知道那里发生了什么——我猜上游在幕后做了一些肮脏的推动，可能吧?)

我最后做的是

# as per https://help.github.com/articles/syncing-a-fork/
git fetch upstream
git checkout master
git merge upstream/master
....
# Lots of conflicts, ended up just abandonging this approach
git reset --hard   # Ditch failed merge
git checkout upstream/master
# Now in detached state
git branch -d master # !
git checkout -b master   # create new master from upstream/master

所以现在我的master再次与upstream/master同步(你可以对任何其他分支重复上面的步骤，你也想进行类似的同步)。