根据这篇文章，使用子树对我来说是有效的，只转移了适用的历史。在这里发布，以防有人需要这些步骤(确保将占位符替换为适用于你的值):

在源存储库中将子文件夹拆分为一个新的分支

Git子树拆分——prefix=<source-path-to-merge> -b subtree-split-result

在你的目标repo合并在拆分结果分支

git remote add merge-source-repo <path-to-your-source-repository>
git fetch merge-source-repo
git merge -s ours --no-commit merge-source-repo/subtree-split-result
git read-tree --prefix=<destination-path-to-merge-into> -u merge-source-repo/subtree-split-result

验证您的更改并提交

git status
git commit

别忘了

通过删除子树拆分结果分支进行清理

git branch -D subtree-split-result

删除为从源repo获取数据而添加的远程

Git远程rm merge-source-repo

下面是脚本，将立即工作。

#!/bin/bash -xe
# script name: merge-repo.sh
# To merge repositories into the current.
# To see the log of the new repo use 'git log --follow -- unprefixed-filename'
# So if the file is repo/test.cpp use 'git log --follow -- test.cpp'
# I'm not sure how this will work when two files have the same name.
#
# `git branch -a` will show newly created branches.
# You can delete them if you want.
merge_another() {
    repo="$1" # url of the remote repo
    rn="$2"   # new name of the repo, you can keep the same name as well.
    git remote add ${rn} ${repo}
    git fetch ${rn}
    git merge -s ours --no-commit --allow-unrelated-histories ${rn}/master
    git read-tree --prefix=${rn}/ -u ${rn}/master
    git commit -m "Imported ${rn} as a subtree."
    git pull -s subtree ${rn} master
}

merge_another $1 $2

运行脚本。转到您希望合并另一个repo的repo，并运行脚本。

cd base-repo
./merge-repo.sh git@github.com:username/repo-to-be-merged.git repo-to-be-merged-new-name

现在将主分支上的更改推到remote/origin。根据您要做的事情，可能不需要此步骤。

git push origin master

请参阅本文中的基本示例，并考虑在存储库上进行这样的映射:

A <-> yyy， B <-> XXX

完成本章描述的所有活动(合并后)，移除分支B-master:

$ git branch -d B-master

然后，推动更改。

这对我很管用。

添加另一个答案，因为我认为这有点简单。将repo_dest拉入到repo_to_import中，然后推入——set-upstream url:repo_dest master。

这种方法对我来说很有效，我把几个较小的回购导入一个较大的回购中。

如何将repo1_to_import导入到repo_dest

# checkout your repo1_to_import if you don't have it already 
git clone url:repo1_to_import repo1_to_import
cd repo1_to_import

# now. pull all of repo_dest
git pull url:repo_dest
ls 
git status # shows Your branch is ahead of 'origin/master' by xx commits.
# now push to repo_dest
git push --set-upstream url:repo_dest master

# repeat for other repositories you want to import

重命名或移动文件和dirs到原始回购所需的位置，然后再进行导入。如。

cd repo1_to_import
mkdir topDir
git add topDir
git mv this that and the other topDir/
git commit -m"move things into topDir in preparation for exporting into new repo"
# now do the pull and push to import

以下链接中描述的方法启发了这个答案。我喜欢它，因为它看起来更简单。但是要小心!有龙!https://help.github.com/articles/importing-an-external-git-repository git push——镜像url:repo_dest将本地的回购历史和状态推送到远程(url:repo_dest)。但是它会删除旧的历史记录和远程状态。乐趣随之而来!: - e

没有足够的代表给x-yuri的回答加上评论，但它工作得很漂亮，保存了历史。 我正在与两个工作的本地回购工作，并收到这个错误:

中止:拒绝破坏性地覆盖此后的回购历史 这看起来不像一个新的克隆体。 (预计新包装的回购) 请改用一个新的克隆体做手术。如果你想继续，那就用武力。

与其担心——force标志的含义，我先在本地克隆了这个repo:

cd tempDir
git clone <location of repo to be merged> --no-local

用这个新克隆的拷贝来执行x-尤里布置的一系列命令。 最后，在:git filter-repo——to-subdirectory-filter a中，a是你要导入的repo根文件夹的名称。

Git仓库本身就有一个著名的实例，在Git社区中被统称为“有史以来最酷的合并”(以Linus Torvalds在给Git邮件列表中描述这次合并的电子邮件的主题行命名)。在这种情况下，gitk Git GUI现在是Git的一部分，实际上曾经是一个单独的项目。Linus设法将该存储库合并到Git存储库中

它出现在Git存储库中，就好像它一直是作为Git的一部分开发的一样， 所有的历史都保存完好 它仍然可以在旧的存储库中独立开发，只需通过git提取更改即可。

电子邮件包含了复制所需的步骤，但不适合胆小的人:首先，Linus写了Git，所以他可能比你我知道得多一些;其次，这是近5年前的事情了，Git从那时起已经有了很大的改进，所以现在可能要容易得多。

特别是，我猜现在人们会在这种特定情况下使用gitk子模块。