我不得不进一步执行John Douth的步骤，并将其cd到子模块的目录中，然后删除Git存储库：

cd submodule
rm -fr .git

然后，我可以将文件作为父Git存储库的一部分提交，而无需对子模块的旧引用。

我创建了一个bash脚本来简化删除过程。它还检查回购中是否有未保存的更改，并请求确认。它已经在os x上进行了测试，如果知道它在普通linux发行版上是否也能正常工作，将会很有趣：

https://gist.github.com/fabifrank/cdc7e67fd194333760b060835ac0172f

总而言之，这是您应该做的：

设置path_to_submodule变量（无尾随斜杠）：path_to_submodule=路径/到/子模块从.gitmodules文件中删除相关行：git-config-f.gitmodules—删除节子模块$路径_子模块从.git/config中删除相关部分git-config-f.git/config—删除节子模块$路径_子模块仅从索引中取消存储并删除$path_to_submodule（以防止丢失信息）git rm--缓存的$path_to_submodule跟踪对.gitmodules所做的更改git-add.gitmodules提交超级项目gitcommit-m“删除子模块子模块名”删除现在未跟踪的子模块文件rm-rf$path_to_submodulerm-rf.git/modules/$path_to_submodule

在这个网站上尝试了所有不同的答案后，我最终得到了这个解决方案：

#!/bin/sh
path="$1"
if [ ! -f "$path/.git" ]; then
  echo "$path is no valid git submodule"
  exit 1
fi
git submodule deinit -f $path &&
git rm --cached $path &&
rm -rf .git/modules/$path &&
rm -rf $path &&
git reset HEAD .gitmodules &&
git config -f .gitmodules --remove-section submodule.$path

这将恢复与添加子模块之前完全相同的状态。您可以立即再次添加子模块，这在大多数答案中是不可能的。

git submodule add $giturl test
aboveScript test

这将使您得到一个干净的签出，无需提交任何更改。

这是用以下方法测试的：

$ git --version
git version 1.9.3 (Apple Git-50)

我发现deinit对我很好：

git submodule deinit <submodule-name>    
git rm <submodule-name>

从git文档：

解交织注销给定子模块，即删除整个子模块$名称git/config中的部分及其工作树。

您可以使用别名自动化其他人提供的解决方案：

[alias]
  rms = "!f(){ git rm --cached \"$1\";rm -r \"$1\";git config -f .gitmodules --remove-section \"submodule.$1\";git config -f .git/config --remove-section \"submodule.$1\";git add .gitmodules; }; f"

将其放入git配置中，然后可以执行：git rms path/to/submodule