是否有一种方便的方法来计算一个序列或一维numpy数组的百分位数?
我正在寻找类似Excel的百分位数函数。
我在NumPy的统计参考中找不到这个。我所能找到的是中位数(第50百分位),但没有更具体的东西。
是否有一种方便的方法来计算一个序列或一维numpy数组的百分位数?
我正在寻找类似Excel的百分位数函数。
我在NumPy的统计参考中找不到这个。我所能找到的是中位数(第50百分位),但没有更具体的东西。
当前回答
要计算一个系列的百分位数,运行:
from scipy.stats import rankdata
import numpy as np
def calc_percentile(a, method='min'):
if isinstance(a, list):
a = np.asarray(a)
return rankdata(a, method=method) / float(len(a))
例如:
a = range(20)
print {val: round(percentile, 3) for val, percentile in zip(a, calc_percentile(a))}
>>> {0: 0.05, 1: 0.1, 2: 0.15, 3: 0.2, 4: 0.25, 5: 0.3, 6: 0.35, 7: 0.4, 8: 0.45, 9: 0.5, 10: 0.55, 11: 0.6, 12: 0.65, 13: 0.7, 14: 0.75, 15: 0.8, 16: 0.85, 17: 0.9, 18: 0.95, 19: 1.0}
其他回答
您可能会对SciPy Stats包感兴趣。它有你所追求的百分位数函数和许多其他统计上的好处。
Percentile()在numpy中也可用。
import numpy as np
a = np.array([1,2,3,4,5])
p = np.percentile(a, 50) # return 50th percentile, e.g median.
print p
3.0
这张票让我相信他们不会很快将percentile()集成到numpy中。
顺便说一下,有一个百分位数函数的纯python实现,以防人们不想依赖scipy。函数复制如下:
## {{{ http://code.activestate.com/recipes/511478/ (r1)
import math
import functools
def percentile(N, percent, key=lambda x:x):
"""
Find the percentile of a list of values.
@parameter N - is a list of values. Note N MUST BE already sorted.
@parameter percent - a float value from 0.0 to 1.0.
@parameter key - optional key function to compute value from each element of N.
@return - the percentile of the values
"""
if not N:
return None
k = (len(N)-1) * percent
f = math.floor(k)
c = math.ceil(k)
if f == c:
return key(N[int(k)])
d0 = key(N[int(f)]) * (c-k)
d1 = key(N[int(c)]) * (k-f)
return d0+d1
# median is 50th percentile.
median = functools.partial(percentile, percent=0.5)
## end of http://code.activestate.com/recipes/511478/ }}}
检查scipy。统计模块:
scipy.stats.scoreatpercentile
从Python 3.8开始,标准库附带了quantiles函数,作为统计模块的一部分:
from statistics import quantiles
quantiles([1, 2, 3, 4, 5], n=100)
# [0.06, 0.12, 0.18, 0.24, 0.3, 0.36, 0.42, 0.48, 0.54, 0.6, 0.66, 0.72, 0.78, 0.84, 0.9, 0.96, 1.02, 1.08, 1.14, 1.2, 1.26, 1.32, 1.38, 1.44, 1.5, 1.56, 1.62, 1.68, 1.74, 1.8, 1.86, 1.92, 1.98, 2.04, 2.1, 2.16, 2.22, 2.28, 2.34, 2.4, 2.46, 2.52, 2.58, 2.64, 2.7, 2.76, 2.82, 2.88, 2.94, 3.0, 3.06, 3.12, 3.18, 3.24, 3.3, 3.36, 3.42, 3.48, 3.54, 3.6, 3.66, 3.72, 3.78, 3.84, 3.9, 3.96, 4.02, 4.08, 4.14, 4.2, 4.26, 4.32, 4.38, 4.44, 4.5, 4.56, 4.62, 4.68, 4.74, 4.8, 4.86, 4.92, 4.98, 5.04, 5.1, 5.16, 5.22, 5.28, 5.34, 5.4, 5.46, 5.52, 5.58, 5.64, 5.7, 5.76, 5.82, 5.88, 5.94]
quantiles([1, 2, 3, 4, 5], n=100)[49] # 50th percentile (e.g median)
# 3.0
Quantiles为给定的分布区域返回n - 1个切割点的列表,分隔n个分位数区间(以等概率将dist划分为n个连续区间):
统计数据。分位数(dist, *, n=4, method='exclusive')
在我们的例子中,n(百分位数)是100。
要计算一个系列的百分位数,运行:
from scipy.stats import rankdata
import numpy as np
def calc_percentile(a, method='min'):
if isinstance(a, list):
a = np.asarray(a)
return rankdata(a, method=method) / float(len(a))
例如:
a = range(20)
print {val: round(percentile, 3) for val, percentile in zip(a, calc_percentile(a))}
>>> {0: 0.05, 1: 0.1, 2: 0.15, 3: 0.2, 4: 0.25, 5: 0.3, 6: 0.35, 7: 0.4, 8: 0.45, 9: 0.5, 10: 0.55, 11: 0.6, 12: 0.65, 13: 0.7, 14: 0.75, 15: 0.8, 16: 0.85, 17: 0.9, 18: 0.95, 19: 1.0}