可选择使用pathlib库(通常优先于os.path)。

该方法避免了重复使用pandas concat()/ apping()。

从熊猫文档中可以看到: 值得注意的是，concat()(因此append())会生成数据的完整副本，并且不断重用此函数会产生显著的性能影响。如果需要对多个数据集使用操作，请使用列表推导式。

import pandas as pd
from pathlib import Path

dir = Path("../relevant_directory")

df = (pd.read_csv(f) for f in dir.glob("*.csv"))
df = pd.concat(df)

我在谷歌上找到了高拉夫·辛格的答案。

然而，到最近为止，我发现使用NumPy进行任何操作，然后将其分配给一个数据帧，而不是在迭代的基础上操作数据帧本身，这似乎在这个解决方案中也有效。

我真诚地希望访问此页的任何人都能考虑这种方法，但我不想将这段巨大的代码作为注释附加，从而降低其可读性。

您可以利用NumPy来真正加速数据帧连接。

import os
import glob
import pandas as pd
import numpy as np

path = "my_dir_full_path"
allFiles = glob.glob(os.path.join(path,"*.csv"))


np_array_list = []
for file_ in allFiles:
    df = pd.read_csv(file_,index_col=None, header=0)
    np_array_list.append(df.as_matrix())

comb_np_array = np.vstack(np_array_list)
big_frame = pd.DataFrame(comb_np_array)

big_frame.columns = ["col1", "col2"....]

时间统计:

total files :192
avg lines per file :8492
--approach 1 without NumPy -- 8.248656988143921 seconds ---
total records old :1630571
--approach 2 with NumPy -- 2.289292573928833 seconds ---

Dask库可以从多个文件中读取数据帧:

>>> import dask.dataframe as dd
>>> df = dd.read_csv('data*.csv')

(来源:https://examples.dask.org/dataframes/01-data-access.html # Read-CSV-files)

Dask数据框架实现了Pandas数据框架API的一个子集。如果所有的数据都适合内存，你可以调用df.compute()将数据帧转换为Pandas数据帧。

darindaCoder的答案的替代方案:

path = r'C:\DRO\DCL_rawdata_files'                     # use your path
all_files = glob.glob(os.path.join(path, "*.csv"))     # advisable to use os.path.join as this makes concatenation OS independent

df_from_each_file = (pd.read_csv(f) for f in all_files)
concatenated_df   = pd.concat(df_from_each_file, ignore_index=True)
# doesn't create a list, nor does it append to one

所有可用的.read_方法参见pandas: IO工具。

如果所有CSV文件都有相同的列，请尝试以下代码。

我添加了header=0，这样在读取CSV文件的第一行之后，就可以将它赋值为列名。

import pandas as pd
import glob
import os

path = r'C:\DRO\DCL_rawdata_files' # use your path
all_files = glob.glob(os.path.join(path , "/*.csv"))

li = []

for filename in all_files:
    df = pd.read_csv(filename, index_col=None, header=0)
    li.append(df)

frame = pd.concat(li, axis=0, ignore_index=True)

或者，归属于Sid的评论。

all_files = glob.glob(os.path.join(path, "*.csv"))

df = pd.concat((pd.read_csv(f) for f in all_files), ignore_index=True)

通常需要标识每个数据样本，这可以通过向数据框架添加一个新列来实现。 本例将使用标准库中的Pathlib。它将路径视为具有方法的对象，而不是要切片的字符串。

导入和设置

from pathlib import Path
import pandas as pd
import numpy as np

path = r'C:\DRO\DCL_rawdata_files'  # or unix / linux / mac path

# Get the files from the path provided in the OP
files = Path(path).glob('*.csv')  # .rglob to get subdirectories

选项1:

添加带有文件名的新列

dfs = list()
for f in files:
    data = pd.read_csv(f)
    # .stem is method for pathlib objects to get the filename w/o the extension
    data['file'] = f.stem
    dfs.append(data)

df = pd.concat(dfs, ignore_index=True)

选项2:

使用enumerate添加具有泛型名称的新列

dfs = list()
for i, f in enumerate(files):
    data = pd.read_csv(f)
    data['file'] = f'File {i}'
    dfs.append(data)

df = pd.concat(dfs, ignore_index=True)

选项3:

使用列表理解创建数据框架，然后使用np。重复此操作以添加新列。 [f' s {i}' for i in range(len(dfs))]创建一个字符串列表来命名每个数据帧。 [len(df) for df in dfs]创建一个长度列表 这个选项的归属归属于这个绘图答案。

# Read the files into dataframes
dfs = [pd.read_csv(f) for f in files]

# Combine the list of dataframes
df = pd.concat(dfs, ignore_index=True)

# Add a new column
df['Source'] = np.repeat([f'S{i}' for i in range(len(dfs))], [len(df) for df in dfs])

选项4:

一行代码使用.assign创建新列，并将其归属于来自C8H10N4O2的注释

df = pd.concat((pd.read_csv(f).assign(filename=f.stem) for f in files), ignore_index=True)

or

df = pd.concat((pd.read_csv(f).assign(Source=f'S{i}') for i, f in enumerate(files)), ignore_index=True)

可选择使用pathlib库(通常优先于os.path)。

该方法避免了重复使用pandas concat()/ apping()。

从熊猫文档中可以看到: 值得注意的是，concat()(因此append())会生成数据的完整副本，并且不断重用此函数会产生显著的性能影响。如果需要对多个数据集使用操作，请使用列表推导式。

import pandas as pd
from pathlib import Path

dir = Path("../relevant_directory")

df = (pd.read_csv(f) for f in dir.glob("*.csv"))
df = pd.concat(df)