使用coryfklein/doctoc, thlorenz/doctoc的一个分支，它不会在每个目录中添加“由doctoc生成”。

npm install -g coryfklein/doctoc

GitHub Pages(基本上是Jekyll的包装器)似乎使用了kramdown，它实现了所有Maruku，因此通过atoc属性支持自动生成的目录:

* auto-gen TOC:
{:toc}

第一行只是开始一个无序列表，实际上被丢弃了。

这将使用文档中的头文件生成一组嵌套的无序列表。

注意:这应该适用于GitHub页面，而不是评论或wiki页面中使用的GitHub调味Markdown (GFM)。我想这个问题没有解决办法。

使用coryfklein/doctoc, thlorenz/doctoc的一个分支，它不会在每个目录中添加“由doctoc生成”。

npm install -g coryfklein/doctoc

这并不是对这个问题的直接回答，因为很多人都提供了变通方法。我认为到目前为止，Github还没有正式支持生成TOC。如果你想让GitHub在他们的GFM预览页面上自动呈现一个目录，请参加关于官方功能请求问题的讨论。

可以从README中使用http://documentup.com/自动生成一个网页。md文件。它不是创建TOC，但对于许多人来说，它可能解决了想要创建TOC的原因。

Documentup的另一个替代方案是Flatdoc: http://ricostacruz.com/flatdoc/

下面是我今天为此编写的shell脚本。可能需要根据你的需要进行调整，但这应该是一个很好的起点。

cat README.md \
    | sed -e '/```/ r pf' -e '/```/,/```/d' \
    | grep "^#" \
    | tail -n +2 \
    | tr -d '`' \
    | sed 's/# \([a-zA-Z0-9`. -]\+\)/- [\1](#\L\1)/' \
    | awk -F'(' '{for(i=2;i<=NF;i++)if(i==2)gsub(" ","-",$i);}1' OFS='(' \
    | sed 's/^####/      /' \
    | sed 's/^###/    /' \
    | sed 's/^##/  /' \
    | sed 's/^#//'

如果有人知道更好的方法来做这些最终的#替换，请添加评论。我尝试了各种各样的方法，但都不满意，所以我就硬着硬着。