I'm using a python script as a driver for a hydrodynamics code. When it comes time to run the simulation, I use subprocess.Popen to run the code, collect the output from stdout and stderr into a subprocess.PIPE --- then I can print (and save to a log-file) the output information, and check for any errors. The problem is, I have no idea how the code is progressing. If I run it directly from the command line, it gives me output about what iteration its at, what time, what the next time-step is, etc.
是否有一种方法既存储输出(用于日志记录和错误检查)，又产生实时流输出?
我的代码的相关部分:
ret_val = subprocess.Popen( run_command, stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.PIPE, shell=True )
output, errors = ret_val.communicate()
log_file.write(output)
print output
if( ret_val.returncode ):
print "RUN failed\n\n%s\n\n" % (errors)
success = False
if( errors ): log_file.write("\n\n%s\n\n" % errors)
最初，我将run_command通过tee输送，以便将副本直接发送到日志文件，流仍然直接输出到终端——但这样我就不能存储任何错误(据我所知)。
目前我的临时解决方案是:
ret_val = subprocess.Popen( run_command, stdout=log_file, stderr=subprocess.PIPE, shell=True )
while not ret_val.poll():
log_file.flush()
然后，在另一个终端上运行tail -f log.txt (s.t. log_file = 'log.txt')。
我发现如何以流的方式读取子进程的输出(同时也在一个变量中捕获它)在Python中(对于多个输出流，即stdout和stderr)是通过传递子进程一个命名的临时文件来写入，然后在单独的读取句柄中打开相同的临时文件。
注意:这是针对Python 3的
stdout_write = tempfile.NamedTemporaryFile()
stdout_read = io.open(stdout_write.name, "r")
stderr_write = tempfile.NamedTemporaryFile()
stderr_read = io.open(stderr_write.name, "r")
stdout_captured = ""
stderr_captured = ""
proc = subprocess.Popen(["command"], stdout=stdout_write, stderr=stderr_write)
while True:
proc_done: bool = cli_process.poll() is not None
while True:
content = stdout_read.read(1024)
sys.stdout.write(content)
stdout_captured += content
if len(content) < 1024:
break
while True:
content = stderr_read.read(1024)
sys.stderr.write(content)
stdout_captured += content
if len(content) < 1024:
break
if proc_done:
break
time.sleep(0.1)
stdout_write.close()
stdout_read.close()
stderr_write.close()
stderr_read.close()
但是，如果您不需要捕获输出，那么您可以简单地传递sys。Stdout和sys。stderr流从你的Python脚本到被调用的子进程，正如xaav在他的回答中建议的那样:
subprocess.Popen(["command"], stdout=sys.stdout, stderr=sys.stderr)
一个好的但“重量级”的解决方案是使用Twisted -见底部。
如果你愿意只使用stdout，那么下面这些代码应该可以工作:
import subprocess
import sys
popenobj = subprocess.Popen(["ls", "-Rl"], stdout=subprocess.PIPE)
while not popenobj.poll():
stdoutdata = popenobj.stdout.readline()
if stdoutdata:
sys.stdout.write(stdoutdata)
else:
break
print "Return code", popenobj.returncode
(如果你使用read()，它会尝试读取整个“文件”，这是没有用的，我们真正可以在这里使用的是读取管道中当前所有数据的东西)
你也可以尝试用线程来解决这个问题，例如:
import subprocess
import sys
import threading
popenobj = subprocess.Popen("ls", stdout=subprocess.PIPE, shell=True)
def stdoutprocess(o):
while True:
stdoutdata = o.stdout.readline()
if stdoutdata:
sys.stdout.write(stdoutdata)
else:
break
t = threading.Thread(target=stdoutprocess, args=(popenobj,))
t.start()
popenobj.wait()
t.join()
print "Return code", popenobj.returncode
现在我们可以通过两个线程来添加stderr。
但是请注意，子进程文档不鼓励直接使用这些文件，并建议使用communication()(主要涉及死锁，我认为这不是上面的问题)，解决方案有点笨，所以看起来子进程模块不太适合这项工作(也请参阅:http://www.python.org/dev/peps/pep-3145/)，我们需要看看其他东西。
一个更复杂的解决方案是使用Twisted，如下所示:https://twistedmatrix.com/documents/11.1.0/core/howto/process.html
Twisted的方法是使用reactor.spawnprocess()创建进程，并提供一个ProcessProtocol，然后异步处理输出。Twisted示例Python代码在这里:https://twistedmatrix.com/documents/11.1.0/core/howto/listings/process/process.py
我尝试过的所有上述解决方案都无法分离stderr和stdout输出(多个管道)，或者当操作系统管道缓冲区已满时永远阻塞，这发生在你运行输出太快的命令时(在python poll() subprocess手册上对此有警告)。我发现唯一可靠的方法是通过选择，但这是一个posix-only解决方案:
import subprocess
import sys
import os
import select
# returns command exit status, stdout text, stderr text
# rtoutput: show realtime output while running
def run_script(cmd,rtoutput=0):
p = subprocess.Popen(cmd, shell=True, stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.PIPE)
poller = select.poll()
poller.register(p.stdout, select.POLLIN)
poller.register(p.stderr, select.POLLIN)
coutput=''
cerror=''
fdhup={}
fdhup[p.stdout.fileno()]=0
fdhup[p.stderr.fileno()]=0
while sum(fdhup.values()) < len(fdhup):
try:
r = poller.poll(1)
except select.error, err:
if err.args[0] != EINTR:
raise
r=[]
for fd, flags in r:
if flags & (select.POLLIN | select.POLLPRI):
c = os.read(fd, 1024)
if rtoutput:
sys.stdout.write(c)
sys.stdout.flush()
if fd == p.stderr.fileno():
cerror+=c
else:
coutput+=c
else:
fdhup[fd]=1
return p.poll(), coutput.strip(), cerror.strip()
在我看来，“来自subprocess命令的实时输出”意味着stdout和stderr都应该是实时的。stdin也应该被传递给子进程。
下面的片段在stdout和stderr上生成实时输出，并在outcome.{stdout,stderr}中将它们作为字节捕获。
窍门包括正确使用select和poll。
在Python 3.9上运行良好。
if self.log == 1:
print(f"** cmnd= {fullCmndStr}")
self.outcome.stdcmnd = fullCmndStr
try:
process = subprocess.Popen(
fullCmndStr,
shell=True,
encoding='utf8',
executable="/bin/bash",
stdin=subprocess.PIPE,
stdout=subprocess.PIPE,
stderr=subprocess.PIPE,
)
except OSError:
self.outcome.error = OSError
else:
process.stdin.write(stdin)
process.stdin.close() # type: ignore
stdoutStrFile = io.StringIO("")
stderrStrFile = io.StringIO("")
pollStdout = select.poll()
pollStderr = select.poll()
pollStdout.register(process.stdout, select.POLLIN)
pollStderr.register(process.stderr, select.POLLIN)
stdoutEOF = False
stderrEOF = False
while True:
stdoutActivity = pollStdout.poll(0)
if stdoutActivity:
c= process.stdout.read(1)
if c:
stdoutStrFile.write(c)
if self.log == 1:
sys.stdout.write(c)
else:
stdoutEOF = True
stderrActivity = pollStderr.poll(0)
if stderrActivity:
c= process.stderr.read(1)
if c:
stderrStrFile.write(c)
if self.log == 1:
sys.stderr.write(c)
else:
stderrEOF = True
if stdoutEOF and stderrEOF:
break
if self.log == 1:
print(f"** cmnd={fullCmndStr}")
process.wait() # type: ignore
self.outcome.stdout = stdoutStrFile.getvalue()
self.outcome.stderr = stderrStrFile.getvalue()
self.outcome.error = process.returncode # type: ignore
