我如何有效地获得一个NumPy数组中每个唯一值的频率计数?
>>> x = np.array([1,1,1,2,2,2,5,25,1,1])
>>> freq_count(x)
[(1, 5), (2, 3), (5, 1), (25, 1)]
当前回答
这是迄今为止最通用和性能最好的解决方案;很惊讶它还没有发布。
import numpy as np
def unique_count(a):
unique, inverse = np.unique(a, return_inverse=True)
count = np.zeros(len(unique), np.int)
np.add.at(count, inverse, 1)
return np.vstack(( unique, count)).T
print unique_count(np.random.randint(-10,10,100))
与目前接受的答案不同，它适用于任何可排序的数据类型(不仅仅是正整数)，并且具有最佳性能;唯一重要的开销是np.unique所做的排序。
其他回答
使用pandas模块:
>>> import pandas as pd
>>> import numpy as np
>>> x = np.array([1,1,1,2,2,2,5,25,1,1])
>>> pd.value_counts(x)
1 5
2 3
25 1
5 1
dtype: int64
numpy。Bincount可能是最好的选择。如果你的数组除了包含小的密集整数之外还包含任何东西，那么像这样包装它可能是有用的:
def count_unique(keys):
uniq_keys = np.unique(keys)
bins = uniq_keys.searchsorted(keys)
return uniq_keys, np.bincount(bins)
例如:
>>> x = array([1,1,1,2,2,2,5,25,1,1])
>>> count_unique(x)
(array([ 1, 2, 5, 25]), array([5, 3, 1, 1]))
使用numpy。唯一的return_counts=True (NumPy 1.9+):
import numpy as np
x = np.array([1,1,1,2,2,2,5,25,1,1])
unique, counts = np.unique(x, return_counts=True)
>>> print(np.asarray((unique, counts)).T)
[[ 1 5]
[ 2 3]
[ 5 1]
[25 1]]
与scipy.stats.itemfreq相比:
In [4]: x = np.random.random_integers(0,100,1e6)
In [5]: %timeit unique, counts = np.unique(x, return_counts=True)
10 loops, best of 3: 31.5 ms per loop
In [6]: %timeit scipy.stats.itemfreq(x)
10 loops, best of 3: 170 ms per loop
尽管这个问题已经得到了回答，但我建议使用一种不同的方法，即numpy.histogram。这样的函数给定一个序列，它返回其元素分组在箱子中的频率。
但是要注意:它在这个例子中是有效的，因为数字是整数。如果它们是实数，那么这个解就不适用了。
>>> from numpy import histogram
>>> y = histogram (x, bins=x.max()-1)
>>> y
(array([5, 3, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
1]),
array([ 1., 2., 3., 4., 5., 6., 7., 8., 9., 10., 11.,
12., 13., 14., 15., 16., 17., 18., 19., 20., 21., 22.,
23., 24., 25.]))
这是迄今为止最通用和性能最好的解决方案;很惊讶它还没有发布。
import numpy as np
def unique_count(a):
unique, inverse = np.unique(a, return_inverse=True)
count = np.zeros(len(unique), np.int)
np.add.at(count, inverse, 1)
return np.vstack(( unique, count)).T
print unique_count(np.random.randint(-10,10,100))
与目前接受的答案不同，它适用于任何可排序的数据类型(不仅仅是正整数)，并且具有最佳性能;唯一重要的开销是np.unique所做的排序。
