WebSite：它会自动生成app_code文件夹，如果您在服务器上发布它，然后如果您对任何特定文件或页面进行一些更改，则不必编译所有文件。

Web应用程序它自动生成网站不生成的解决方案文件，如果您在一个文件中进行更改，则必须编译整个项目以反映其更改。

WebSite：它会自动生成app_code文件夹，如果您在服务器上发布它，然后如果您对任何特定文件或页面进行一些更改，则不必编译所有文件。

Web应用程序它自动生成网站不生成的解决方案文件，如果您在一个文件中进行更改，则必须编译整个项目以反映其更改。

网站=当网站由图形设计师创建且程序员仅编辑一到两页时使用

Web应用程序=当应用程序由程序员创建且图形设计师仅编辑一页或两页/图像时使用。

网站可以使用任何HTML工具进行工作，而不必使用开发人员工作室，因为项目文件不需要更新等。当团队主要使用开发人员studio并且代码内容较高时，Web应用程序是最佳的。

（某些编码错误在编译时在Web应用程序中发现，直到运行时才在Web站点中发现。）

警告：我多年前就写过这个答案，之后就再也没有使用Asp.net了。我想事情已经开始了。

我建议您观看ASP.NET网站上的“Web应用程序项目和Web部署项目”视频，该视频非常详细地解释了差异，这对我很有帮助。

顺便说一句，不要被标题所迷惑，视频的很大一部分解释了网站项目和web应用程序项目之间的区别，以及为什么Microsoft在Visual studio 2005中重新引入web应用程序（正如您可能已经知道的那样，它最初只提供网站项目，然后在SP1中添加了web应用程序）。这是一个很棒的视频，我强烈推荐给任何想了解差异的人。

除非您特别需要动态编译的项目，否则不要使用网站项目。

为什么？因为当你试图改变或理解你的项目时，网站项目会把你逼疯。Visual Studio中的静态类型查找功能（例如查找用法、重构）将永远适用于任何大小合理的项目。有关详细信息，请参阅Visual Studio中的堆栈溢出问题慢速“查找所有引用”。

我真的看不出他们为什么会放弃Visual Studio 2005中的web应用程序，因为它是一种令人痛苦、精神错乱、效率低下的网站项目类型。

来自MCTS自定进度训练包考试70-515书：

利用web应用程序（项目），您可以创建MVC应用程序。Visual Studio将文件列表存储在项目文件（.csproj或.vbproj）中，而不是依赖于文件夹结构。不能混合使用Visual Basic和C#。不停止调试会话就无法编辑代码。您可以在多个web项目之间建立依赖关系。您必须在部署之前编译应用程序，这将阻止您在另一页无法编译时测试该页。您不必将源代码存储在服务器上。您可以控制程序集名称和版本。如果不重新编译，则无法在部署后编辑单个文件。