背景

我刚刚把我的熊猫从0.11升级到0.13.0rc1。现在,应用程序弹出了许多新的警告。其中一个是这样的:

E:\FinReporter\FM_EXT.py:449: SettingWithCopyWarning: A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_index,col_indexer] = value instead
  quote_df['TVol']   = quote_df['TVol']/TVOL_SCALE

我想知道这到底是什么意思?我需要改变什么吗?

如果我坚持使用quote_df['TVol'] = quote_df['TVol']/TVOL_SCALE,我应该如何暂停警告?

给出错误的函数

def _decode_stock_quote(list_of_150_stk_str):
    """decode the webpage and return dataframe"""

    from cStringIO import StringIO

    str_of_all = "".join(list_of_150_stk_str)

    quote_df = pd.read_csv(StringIO(str_of_all), sep=',', names=list('ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZabcdefg')) #dtype={'A': object, 'B': object, 'C': np.float64}
    quote_df.rename(columns={'A':'STK', 'B':'TOpen', 'C':'TPCLOSE', 'D':'TPrice', 'E':'THigh', 'F':'TLow', 'I':'TVol', 'J':'TAmt', 'e':'TDate', 'f':'TTime'}, inplace=True)
    quote_df = quote_df.ix[:,[0,3,2,1,4,5,8,9,30,31]]
    quote_df['TClose'] = quote_df['TPrice']
    quote_df['RT']     = 100 * (quote_df['TPrice']/quote_df['TPCLOSE'] - 1)
    quote_df['TVol']   = quote_df['TVol']/TVOL_SCALE
    quote_df['TAmt']   = quote_df['TAmt']/TAMT_SCALE
    quote_df['STK_ID'] = quote_df['STK'].str.slice(13,19)
    quote_df['STK_Name'] = quote_df['STK'].str.slice(21,30)#.decode('gb2312')
    quote_df['TDate']  = quote_df.TDate.map(lambda x: x[0:4]+x[5:7]+x[8:10])
    
    return quote_df

更多错误消息

E:\FinReporter\FM_EXT.py:449: SettingWithCopyWarning: A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_index,col_indexer] = value instead
  quote_df['TVol']   = quote_df['TVol']/TVOL_SCALE
E:\FinReporter\FM_EXT.py:450: SettingWithCopyWarning: A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_index,col_indexer] = value instead
  quote_df['TAmt']   = quote_df['TAmt']/TAMT_SCALE
E:\FinReporter\FM_EXT.py:453: SettingWithCopyWarning: A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_index,col_indexer] = value instead
  quote_df['TDate']  = quote_df.TDate.map(lambda x: x[0:4]+x[5:7]+x[8:10])

当前回答

熊猫数据帧拷贝警告

当你这样做的时候:

quote_df = quote_df.ix[:,[0,3,2,1,4,5,8,9,30,31]]

熊猫。在这种情况下,Ix返回一个新的、独立的数据框架。

任何你决定在这个数据框架中改变的值,都不会改变原始数据框架。

这就是熊猫想要警告你的。


为什么。ix是个坏主意

.ix对象试图做不止一件事,对于任何读过干净代码的人来说,这是一种强烈的气味。

给定这个数据框架:

df = pd.DataFrame({"a": [1,2,3,4], "b": [1,1,2,2]})

两个行为:

dfcopy = df.ix[:,["a"]]
dfcopy.a.ix[0] = 2

行为一:dfcopy现在是一个独立的数据框架。改变它不会改变df

df.ix[0, "a"] = 3

行为二:这将改变原始的数据框架。


请改用.loc

pandas开发人员意识到.ix对象很臭(推测性的),因此创建了两个新对象来帮助添加和分配数据。(另一个是。iloc)

.loc更快,因为它不尝试创建数据的副本。

.loc的目的是修改现有的数据帧,这是更有效的内存。

.loc是可预测的,它有一个行为。


解决方案

您在代码示例中所做的是加载一个包含许多列的大文件,然后将其修改为较小的文件。

pd。Read_csv函数可以帮助您解决这些问题,并使文件的加载速度更快。

所以不这样做

quote_df = pd.read_csv(StringIO(str_of_all), sep=',', names=list('ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZabcdefg')) #dtype={'A': object, 'B': object, 'C': np.float64}
quote_df.rename(columns={'A':'STK', 'B':'TOpen', 'C':'TPCLOSE', 'D':'TPrice', 'E':'THigh', 'F':'TLow', 'I':'TVol', 'J':'TAmt', 'e':'TDate', 'f':'TTime'}, inplace=True)
quote_df = quote_df.ix[:,[0,3,2,1,4,5,8,9,30,31]]

这样做

columns = ['STK', 'TPrice', 'TPCLOSE', 'TOpen', 'THigh', 'TLow', 'TVol', 'TAmt', 'TDate', 'TTime']
df = pd.read_csv(StringIO(str_of_all), sep=',', usecols=[0,3,2,1,4,5,8,9,30,31])
df.columns = columns

这将只读取您感兴趣的列,并正确地命名它们。不需要使用邪恶的.ix对象来做神奇的事情。

其他回答

后续初学者问题/备注

也许这是对像我这样的初学者的澄清(我来自R,它的工作原理似乎有点不同)。以下看起来无害的功能代码不断产生SettingWithCopy警告,我不知道为什么。我已经阅读并理解了“链式索引”,但我的代码不包含任何:

def plot(pdb, df, title, **kw):
    df['target'] = (df['ogg'] + df['ugg']) / 2
    # ...

但是后来,太迟了,我查看了plot()函数被调用的地方:

    df = data[data['anz_emw'] > 0]
    pixbuf = plot(pdb, df, title)

所以"df"不是一个数据帧,而是一个对象,它以某种方式记住它是通过索引一个数据帧创建的(这是一个视图吗?)这将使plot()中的行,

 df['target'] = ...

相当于

 data[data['anz_emw'] > 0]['target'] = ...

这是链式索引。

不管怎么说,

def plot(pdb, df, title, **kw):
    df.loc[:,'target'] = (df['ogg'] + df['ugg']) / 2

固定它。

如何处理SettingWithCopyWarning在熊猫?

这篇文章的读者是:

想知道这个警告是什么意思吗 想了解压制这种警告的不同方法吗 想了解如何改进他们的代码,并遵循良好的实践,以避免在未来出现这种警告。

设置

np.random.seed(0)
df = pd.DataFrame(np.random.choice(10, (3, 5)), columns=list('ABCDE'))
df
   A  B  C  D  E
0  5  0  3  3  7
1  9  3  5  2  4
2  7  6  8  8  1

什么是SettingWithCopyWarning?

要知道如何处理这个警告,首先要理解它的含义以及为什么会提出这个警告。

过滤dataframe时,可以对帧进行切片/索引以返回视图或副本,这取决于内部布局和各种实现细节。顾名思义,“视图”是原始数据的视图,因此修改视图可能会修改原始对象。另一方面,“副本”是原始数据的复制,修改副本对原始数据没有影响。

正如其他答案所提到的,SettingWithCopyWarning被创建来标记“链式赋值”操作。考虑上面设置中的df。假设您想要选择列“B”中的所有值,其中列“A”中的值为> 5。Pandas允许您以不同的方式做到这一点,有些方式比其他方式更正确。例如,

df[df.A > 5]['B']

1    3
2    6
Name: B, dtype: int64

And,

df.loc[df.A > 5, 'B']

1    3
2    6
Name: B, dtype: int64

它们返回相同的结果,因此如果只读取这些值,则没有区别。那么,问题是什么呢?链式赋值的问题是,通常很难预测返回的是视图还是副本,所以当您试图赋值时,这在很大程度上成为一个问题。在前面例子的基础上,考虑一下这段代码是如何被解释器执行的:

df.loc[df.A > 5, 'B'] = 4
# becomes
df.__setitem__((df.A > 5, 'B'), 4)

用一个__setitem__调用df。OTOH,考虑下面的代码:

df[df.A > 5]['B'] = 4
# becomes
df.__getitem__(df.A > 5).__setitem__('B', 4)

现在,根据__getitem__返回的是视图还是副本,__setitem__操作可能无法工作。

一般来说,应该使用loc进行基于标签的赋值,使用iloc进行基于整数/位置的赋值,因为规范保证它们总是对原始值进行操作。此外,要设置单个单元格,应该使用at和iat。

更多信息可以在文档中找到。

请注意 所有用loc完成的布尔索引操作也可以用iloc完成。唯一的区别是iloc希望两者都有 索引的整数/位置或布尔值的numpy数组,以及 列的整数/位置索引。 例如, df.loc (df。A > 5, ' b '] = 4 可以写成nas df.iloc [(df。A > 5).values, 1] = 4 而且, df。loc[1, 'A'] = 100 可以写成 df。Iloc [1,0] = 100 等等。


告诉我怎么消除警告!

考虑df的“a”列上的一个简单操作。选择“A”并除以2将会发出警告,但操作是有效的。

df2 = df[['A']]
df2['A'] /= 2
/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/IPython/__main__.py:1: SettingWithCopyWarning:
A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_indexer,col_indexer] = value instead

df2
     A
0  2.5
1  4.5
2  3.5

有几种方法可以直接屏蔽这个警告:

(推荐)使用loc对子集进行切片: Df2 = df。loc [: [A]] df2['A'] /= 2 #不提升 改变pd.options.mode.chained_assignment 可以设置为None、warn或raise。“warn”是默认值。None将完全抑制警告,“raise”将抛出SettingWithCopyError,阻止操作进行。 pd.options.mode。chained_assignment =无 df2['A'] /= 2 制作深度拷贝 df2 = df[['A']]].copy(depth =True) df2['A'] /= 2

@Peter Cotton在评论中提出了一个很好的方法,使用上下文管理器非侵入性地改变模式(从这个要点修改),只在需要时设置模式,并在完成时将其重置回原始状态。

类ChainedAssignent: def __init__(self, chained=None): accept = [None, 'warn', 'raise'] Assert chained in acceptable, "chained must be in " + str(acceptable) 自我。被链住 def __enter__(自我): 自我。Saved_swcw = pd.options.mode.chained_assignment pd.options.mode。Chained_assignment = self.swcw 回归自我 Def __exit__(self, *args): pd.options.mode。Chained_assignment = self.saved_swcw

用法如下:

# Some code here
with ChainedAssignent():
    df2['A'] /= 2
# More code follows

或者,抛出异常

with ChainedAssignent(chained='raise'):
    df2['A'] /= 2

SettingWithCopyError:
A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_indexer,col_indexer] = value instead

“XY问题”:我做错了什么?

很多时候,用户试图寻找抑制这种异常的方法,而没有完全理解为什么会出现这种异常。这是XY问题的一个很好的例子,用户试图解决一个问题“Y”,而这个问题实际上是一个更深层次的问题“X”的症状。将根据遇到此警告的常见问题提出问题,然后将提出解决方案。

问题1 我有一个数据框架 df A bc d e 0 5 0 3 3 7 1 9 3 5 2 4 2 7 6 8 8 1 我想在col“A”> 5到1000中赋值。我的期望输出是 A bc d e 0 5 0 3 3 7 1 1000 3 5 2 4 2 1000 6 8 8 1

错误的做法:

df.A[df.A > 5] = 1000         # works, because df.A returns a view
df[df.A > 5]['A'] = 1000      # does not work
df.loc[df.A > 5]['A'] = 1000   # does not work

使用loc的正确方法:

df.loc[df.A > 5, 'A'] = 1000

问题21 我试图将单元格(1,'D')中的值设置为12345。我的期望输出是 A bc d e 0 5 0 3 3 7 1 9 3 5 1245 4 2 7 6 8 8 1 我试过各种方法进入这个细胞,比如 df [' D '][1]。最好的方法是什么? 1. 这个问题和警告没有特别的关系,但是 最好能理解如何正确地执行这个特定的操作 这样就可以避免出现警告可能出现的情况 的未来。

您可以使用以下任何一种方法来做到这一点。

df.loc[1, 'D'] = 12345
df.iloc[1, 3] = 12345
df.at[1, 'D'] = 12345
df.iat[1, 3] = 12345

问题3 我正在尝试基于某些条件的子集值。我有一个 DataFrame A bc d e 1 9 3 5 2 4 2 7 6 8 8 1 我想把“D”中的值赋给123,这样“C”== 5。我 试着 df2.loc[df2.C == 5, 'D'] = 123 这看起来很好,但我还是得到了 SettingWithCopyWarning !我怎么解决这个问题?

这实际上可能是因为管道中更高级别的代码。你是从更大的东西中创建df2的吗

df2 = df[df.A > 5]

? 在本例中,布尔索引将返回一个视图,因此df2将引用原始视图。你需要做的是将df2分配给一个副本:

df2 = df[df.A > 5].copy()
# Or,
# df2 = df.loc[df.A > 5, :]

问题4 我要把C列放到 A bc d e 1 9 3 5 2 4 2 7 6 8 8 1 但使用 df2。drop('C', axis=1, inplace=True) 抛出SettingWithCopyWarning。为什么会这样?

这是因为df2必须是作为其他切片操作的视图创建的,例如

df2 = df[df.A > 5]

这里的解决方案是创建df的copy(),或者像以前一样使用loc。

熊猫数据帧拷贝警告

当你这样做的时候:

quote_df = quote_df.ix[:,[0,3,2,1,4,5,8,9,30,31]]

熊猫。在这种情况下,Ix返回一个新的、独立的数据框架。

任何你决定在这个数据框架中改变的值,都不会改变原始数据框架。

这就是熊猫想要警告你的。


为什么。ix是个坏主意

.ix对象试图做不止一件事,对于任何读过干净代码的人来说,这是一种强烈的气味。

给定这个数据框架:

df = pd.DataFrame({"a": [1,2,3,4], "b": [1,1,2,2]})

两个行为:

dfcopy = df.ix[:,["a"]]
dfcopy.a.ix[0] = 2

行为一:dfcopy现在是一个独立的数据框架。改变它不会改变df

df.ix[0, "a"] = 3

行为二:这将改变原始的数据框架。


请改用.loc

pandas开发人员意识到.ix对象很臭(推测性的),因此创建了两个新对象来帮助添加和分配数据。(另一个是。iloc)

.loc更快,因为它不尝试创建数据的副本。

.loc的目的是修改现有的数据帧,这是更有效的内存。

.loc是可预测的,它有一个行为。


解决方案

您在代码示例中所做的是加载一个包含许多列的大文件,然后将其修改为较小的文件。

pd。Read_csv函数可以帮助您解决这些问题,并使文件的加载速度更快。

所以不这样做

quote_df = pd.read_csv(StringIO(str_of_all), sep=',', names=list('ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZabcdefg')) #dtype={'A': object, 'B': object, 'C': np.float64}
quote_df.rename(columns={'A':'STK', 'B':'TOpen', 'C':'TPCLOSE', 'D':'TPrice', 'E':'THigh', 'F':'TLow', 'I':'TVol', 'J':'TAmt', 'e':'TDate', 'f':'TTime'}, inplace=True)
quote_df = quote_df.ix[:,[0,3,2,1,4,5,8,9,30,31]]

这样做

columns = ['STK', 'TPrice', 'TPCLOSE', 'TOpen', 'THigh', 'TLow', 'TVol', 'TAmt', 'TDate', 'TTime']
df = pd.read_csv(StringIO(str_of_all), sep=',', usecols=[0,3,2,1,4,5,8,9,30,31])
df.columns = columns

这将只读取您感兴趣的列,并正确地命名它们。不需要使用邪恶的.ix对象来做神奇的事情。

这可能只适用于NumPy,这意味着你可能需要导入它,但我为示例NumPy使用的数据在计算中不是必需的,但你可以简单地通过使用下面这一行代码来停止这个设置和复制警告消息:

np.warnings.filterwarnings('ignore')

对我来说,这个问题发生在下面一个简化的例子中。我也能够解决它(希望有一个正确的解决方案):

带有警告的旧代码:

def update_old_dataframe(old_dataframe, new_dataframe):
    for new_index, new_row in new_dataframe.iterrorws():
        old_dataframe.loc[new_index] = update_row(old_dataframe.loc[new_index], new_row)

def update_row(old_row, new_row):
    for field in [list_of_columns]:
        # line with warning because of chain indexing old_dataframe[new_index][field]
        old_row[field] = new_row[field]
    return old_row

输出old_row[field] = new_row[field]行的警告

因为update_row方法中的行实际上是Series类型,所以我将行替换为:

old_row.at[field] = new_row.at[field]

例如,用于访问/查找一个Series的方法。尽管两者都工作得很好,结果是相同的,这样我就不必禁用警告(=保留它们用于其他地方的其他链索引问题)。