我有两个不同形状的numpy数组,但具有相同的长度(前维数)。我想对它们进行洗牌,以便相应的元素继续对应——即根据它们的前导索引对它们进行一致的洗牌。

这段代码可以工作,并说明了我的目标:

def shuffle_in_unison(a, b):
    assert len(a) == len(b)
    shuffled_a = numpy.empty(a.shape, dtype=a.dtype)
    shuffled_b = numpy.empty(b.shape, dtype=b.dtype)
    permutation = numpy.random.permutation(len(a))
    for old_index, new_index in enumerate(permutation):
        shuffled_a[new_index] = a[old_index]
        shuffled_b[new_index] = b[old_index]
    return shuffled_a, shuffled_b

例如:

>>> a = numpy.asarray([[1, 1], [2, 2], [3, 3]])
>>> b = numpy.asarray([1, 2, 3])
>>> shuffle_in_unison(a, b)
(array([[2, 2],
       [1, 1],
       [3, 3]]), array([2, 1, 3]))

然而,这感觉很笨拙、效率低、速度慢,而且需要复制数组——我宁愿在适当的位置重新排列它们,因为它们会相当大。

还有更好的办法吗?更快的执行和更低的内存使用是我的主要目标,但优雅的代码也会很好。

我的另一个想法是:

def shuffle_in_unison_scary(a, b):
    rng_state = numpy.random.get_state()
    numpy.random.shuffle(a)
    numpy.random.set_state(rng_state)
    numpy.random.shuffle(b)

这工作…但这有点可怕,因为我几乎没有看到它会继续工作的保证——例如,它看起来不像是那种保证在numpy版本中存活的东西。


当前回答

假设我们有两个数组a和b。

a = np.array([[1,2,3],[4,5,6],[7,8,9]])
b = np.array([[9,1,1],[6,6,6],[4,2,0]]) 

我们首先可以通过排列一维来获得行下标

indices = np.random.permutation(a.shape[0])
[1 2 0]

然后使用高级索引。 在这里,我们使用相同的下标来一致地洗牌两个数组。

a_shuffled = a[indices[:,np.newaxis], np.arange(a.shape[1])]
b_shuffled = b[indices[:,np.newaxis], np.arange(b.shape[1])]

这相当于

np.take(a, indices, axis=0)
[[4 5 6]
 [7 8 9]
 [1 2 3]]

np.take(b, indices, axis=0)
[[6 6 6]
 [4 2 0]
 [9 1 1]]

其他回答

这似乎是一个非常简单的解决方案:

import numpy as np
def shuffle_in_unison(a,b):

    assert len(a)==len(b)
    c = np.arange(len(a))
    np.random.shuffle(c)

    return a[c],b[c]

a =  np.asarray([[1, 1], [2, 2], [3, 3]])
b =  np.asarray([11, 22, 33])

shuffle_in_unison(a,b)
Out[94]: 
(array([[3, 3],
        [2, 2],
        [1, 1]]),
 array([33, 22, 11]))

只使用NumPy在原地将任意数量的数组洗牌在一起。

import numpy as np


def shuffle_arrays(arrays, set_seed=-1):
    """Shuffles arrays in-place, in the same order, along axis=0

    Parameters:
    -----------
    arrays : List of NumPy arrays.
    set_seed : Seed value if int >= 0, else seed is random.
    """
    assert all(len(arr) == len(arrays[0]) for arr in arrays)
    seed = np.random.randint(0, 2**(32 - 1) - 1) if set_seed < 0 else set_seed

    for arr in arrays:
        rstate = np.random.RandomState(seed)
        rstate.shuffle(arr)

可以这样使用

a = np.array([1, 2, 3, 4, 5])
b = np.array([10,20,30,40,50])
c = np.array([[1,10,11], [2,20,22], [3,30,33], [4,40,44], [5,50,55]])

shuffle_arrays([a, b, c])

有几件事需要注意:

断言确保所有输入数组都具有相同的长度 第一个维度。 数组按其第一个维度重新排列-没有返回任何内容。 在正int32范围内的随机种子。 如果需要可重复洗牌,则可以设置种子值。

shuffle之后,可以使用np对数据进行拆分。使用片分割或引用-取决于应用程序。

你可以像这样创建一个数组:

s = np.arange(0, len(a), 1)

然后洗牌:

np.random.shuffle(s)

现在使用这个s作为数组的参数。相同的打乱参数返回相同的打乱向量。

x_data = x_data[s]
x_label = x_label[s]

如果您想避免复制数组,那么我建议您不生成一个置换列表,而是遍历数组中的每个元素,并随机将其交换到数组中的另一个位置

for old_index in len(a):
    new_index = numpy.random.randint(old_index+1)
    a[old_index], a[new_index] = a[new_index], a[old_index]
    b[old_index], b[new_index] = b[new_index], b[old_index]

实现了Knuth-Fisher-Yates shuffle算法。

from np.random import permutation
from sklearn.datasets import load_iris
iris = load_iris()
X = iris.data #numpy array
y = iris.target #numpy array

# Data is currently unshuffled; we should shuffle 
# each X[i] with its corresponding y[i]
perm = permutation(len(X))
X = X[perm]
y = y[perm]