我有两个不同形状的numpy数组,但具有相同的长度(前维数)。我想对它们进行洗牌,以便相应的元素继续对应——即根据它们的前导索引对它们进行一致的洗牌。

这段代码可以工作,并说明了我的目标:

def shuffle_in_unison(a, b):
    assert len(a) == len(b)
    shuffled_a = numpy.empty(a.shape, dtype=a.dtype)
    shuffled_b = numpy.empty(b.shape, dtype=b.dtype)
    permutation = numpy.random.permutation(len(a))
    for old_index, new_index in enumerate(permutation):
        shuffled_a[new_index] = a[old_index]
        shuffled_b[new_index] = b[old_index]
    return shuffled_a, shuffled_b

例如:

>>> a = numpy.asarray([[1, 1], [2, 2], [3, 3]])
>>> b = numpy.asarray([1, 2, 3])
>>> shuffle_in_unison(a, b)
(array([[2, 2],
       [1, 1],
       [3, 3]]), array([2, 1, 3]))

然而,这感觉很笨拙、效率低、速度慢,而且需要复制数组——我宁愿在适当的位置重新排列它们,因为它们会相当大。

还有更好的办法吗?更快的执行和更低的内存使用是我的主要目标,但优雅的代码也会很好。

我的另一个想法是:

def shuffle_in_unison_scary(a, b):
    rng_state = numpy.random.get_state()
    numpy.random.shuffle(a)
    numpy.random.set_state(rng_state)
    numpy.random.shuffle(b)

这工作…但这有点可怕,因为我几乎没有看到它会继续工作的保证——例如,它看起来不像是那种保证在numpy版本中存活的东西。


当前回答

有一个众所周知的函数可以处理这个问题:

from sklearn.model_selection import train_test_split
X, _, Y, _ = train_test_split(X,Y, test_size=0.0)

只要将test_size设置为0,就可以避免分裂并得到打乱的数据。 虽然它通常用于分割训练和测试数据,但它也会打乱它们。 从文档

将数组或矩阵分割为随机的训练和测试子集 包装输入验证和的快速实用程序 next (ShuffleSplit()。split(X, y))和应用程序将数据输入到 类中拆分(和可选子采样)数据的单个调用 oneliner。

其他回答

这似乎是一个非常简单的解决方案:

import numpy as np
def shuffle_in_unison(a,b):

    assert len(a)==len(b)
    c = np.arange(len(a))
    np.random.shuffle(c)

    return a[c],b[c]

a =  np.asarray([[1, 1], [2, 2], [3, 3]])
b =  np.asarray([11, 22, 33])

shuffle_in_unison(a,b)
Out[94]: 
(array([[3, 3],
        [2, 2],
        [1, 1]]),
 array([33, 22, 11]))
X = np.array([[1., 0.], [2., 1.], [0., 0.]])
y = np.array([0, 1, 2])
from sklearn.utils import shuffle
X, y = shuffle(X, y, random_state=0)

欲了解更多,请访问http://scikit-learn.org/stable/modules/generated/sklearn.utils.shuffle.html

你的“可怕”解决方案对我来说并不可怕。对两个相同长度的序列调用shuffle()会导致对随机数生成器的相同次数的调用,并且这些是shuffle算法中唯一的“随机”元素。通过重置状态,可以确保对随机数生成器的调用将在对shuffle()的第二次调用中给出相同的结果,因此整个算法将生成相同的排列。

如果您不喜欢这样,另一种解决方案是将数据存储在一个数组中,而不是从一开始就存储在两个数组中,并在这个数组中创建两个视图,模拟您现在拥有的两个数组。您可以将单个数组用于变换,而将视图用于所有其他目的。

示例:让我们假设数组a和b是这样的:

a = numpy.array([[[  0.,   1.,   2.],
                  [  3.,   4.,   5.]],

                 [[  6.,   7.,   8.],
                  [  9.,  10.,  11.]],

                 [[ 12.,  13.,  14.],
                  [ 15.,  16.,  17.]]])

b = numpy.array([[ 0.,  1.],
                 [ 2.,  3.],
                 [ 4.,  5.]])

我们现在可以构造一个包含所有数据的数组:

c = numpy.c_[a.reshape(len(a), -1), b.reshape(len(b), -1)]
# array([[  0.,   1.,   2.,   3.,   4.,   5.,   0.,   1.],
#        [  6.,   7.,   8.,   9.,  10.,  11.,   2.,   3.],
#        [ 12.,  13.,  14.,  15.,  16.,  17.,   4.,   5.]])

现在我们创建了模拟原始a和b的视图:

a2 = c[:, :a.size//len(a)].reshape(a.shape)
b2 = c[:, a.size//len(a):].reshape(b.shape)

a2和b2的数据与c共享。要同时洗牌两个数组,请使用numpy.random.shuffle(c)。

在生产代码中,你当然会尽量避免创建原始的a和b,而直接创建c, a2和b2。

这个解决方案可以适用于a和b具有不同的dtype的情况。

只使用NumPy在原地将任意数量的数组洗牌在一起。

import numpy as np


def shuffle_arrays(arrays, set_seed=-1):
    """Shuffles arrays in-place, in the same order, along axis=0

    Parameters:
    -----------
    arrays : List of NumPy arrays.
    set_seed : Seed value if int >= 0, else seed is random.
    """
    assert all(len(arr) == len(arrays[0]) for arr in arrays)
    seed = np.random.randint(0, 2**(32 - 1) - 1) if set_seed < 0 else set_seed

    for arr in arrays:
        rstate = np.random.RandomState(seed)
        rstate.shuffle(arr)

可以这样使用

a = np.array([1, 2, 3, 4, 5])
b = np.array([10,20,30,40,50])
c = np.array([[1,10,11], [2,20,22], [3,30,33], [4,40,44], [5,50,55]])

shuffle_arrays([a, b, c])

有几件事需要注意:

断言确保所有输入数组都具有相同的长度 第一个维度。 数组按其第一个维度重新排列-没有返回任何内容。 在正int32范围内的随机种子。 如果需要可重复洗牌,则可以设置种子值。

shuffle之后,可以使用np对数据进行拆分。使用片分割或引用-取决于应用程序。

上面的大多数解都是可行的,但是如果你有列向量,你必须先转置它们。这里有一个例子

def shuffle(self) -> None:
    """
    Shuffles X and Y
    """
    x = self.X.T
    y = self.Y.T
    p = np.random.permutation(len(x))
    self.X = x[p].T
    self.Y = y[p].T