以下方法非常有效

<empty line>
[whatever comment text]::

该方法利用语法通过引用创建链接由于使用[1]创建了链接引用：http://example.org不会呈现，同样，以下任何内容也不会呈现

<empty line>
[whatever]::
[whatever]:whatever
[whatever]: :
[whatever]: whatever
[whatever]: # whatever with spaces

kramdown基于Ruby的markdown引擎，这是Jekyll的默认引擎，因此GitHubPages通过其扩展语法内置了注释支持：

{::comment}
This text is completely ignored by kramdown - a comment in the text.
{:/comment}

Do you see {::comment}this text{:/comment}?
{::comment}some other comment{:/}

这样做的好处是允许在线评论，但缺点是不能移植到其他Markdown引擎。

我相信，所有先前提出的解决方案（除了那些需要特定实现的解决方案）都会导致注释包含在输出HTML中，即使它们没有显示出来。

如果你想要一个完全属于你自己的评论（转换文档的读者应该看不到它，即使使用“查看源代码”），你可以（ab）使用核心Markdown规范中提供的链接标签（用于参考样式链接）：

http://daringfireball.net/projects/markdown/syntax#link

即：

[comment]: <> (This is a comment, it will not be included)
[comment]: <> (in  the output file unless you use it in)
[comment]: <> (a reference style link.)

或者您可以进一步：

[//]: <> (This is also a comment.)

为了提高平台兼容性（并节省一次按键），也可以使用#（这是合法的超链接目标）而不是<>：

[//]: # (This may be the most platform independent comment)

为了实现最大的可移植性，在这种类型的注释前后插入一个空行是很重要的，因为某些Markdown解析器在定义碰到常规文本时无法正常工作。Babelmark的最新研究表明，前后空白行都很重要。如果前面没有空行，一些解析器将输出注释，如果后面没有空行则一些解析器将排除以下行。

通常，这种方法应该适用于大多数Markdown解析器，因为它是核心规范的一部分。（即使定义了多个链接时的行为，或定义了链接但从未使用时的行为也未严格指定）。

如果您正在使用Jekyll或octopress，下面的操作也会起作用。

{% comment %} 
    These commments will not include inside the source.
{% endcomment %}

Liquid标记｛%comment%｝首先被解析，并在MarkDown处理器到达它之前被删除。访问者在尝试从浏览器查看源代码时将看不到。

对于PandocMarkdown，我使用带有注释的反引号作为内联“代码”语法的语言

`here's a comment`{=comment}

这将在所有输出中自动过滤掉。它只是重载它们的代码语法，也适用于多行注释的代码块。我还没有尝试过，但我猜这对非潘多克·马克顿来说不起作用。

以下方法非常有效

<empty line>
[whatever comment text]::

该方法利用语法通过引用创建链接由于使用[1]创建了链接引用：http://example.org不会呈现，同样，以下任何内容也不会呈现

<empty line>
[whatever]::
[whatever]:whatever
[whatever]: :
[whatever]: whatever
[whatever]: # whatever with spaces