如果你使用ByteArrayOutputStream，你会做一个额外的拷贝。如果你在开始读取流之前知道它的长度(例如，InputStream实际上是FileInputStream，你可以在文件上调用file.length()，或者InputStream是一个zipfile条目InputStream，你可以调用zipEntry.length())，那么直接写入byte[]数组会更好——它使用一半的内存，并节省时间。

// Read the file contents into a byte[] array
byte[] buf = new byte[inputStreamLength];
int bytesRead = Math.max(0, inputStream.read(buf));

// If needed: for safety, truncate the array if the file may somehow get
// truncated during the read operation
byte[] contents = bytesRead == inputStreamLength ? buf
                  : Arrays.copyOf(buf, bytesRead);

注意:上面的最后一行处理的是在读取流时被截断的文件，如果你需要处理这种可能性，但是如果在读取流时文件变长了，byte[]数组中的内容将不会被延长以包括新的文件内容，数组将简单地被截断为旧的长度inputStreamLength。

您可以使用Apache Commons IO来处理这个任务和类似的任务。

IOUtils类型有一个静态方法来读取InputStream并返回一个字节[]。

InputStream is;
byte[] bytes = IOUtils.toByteArray(is);

这将在内部创建一个ByteArrayOutputStream并将字节复制到输出，然后调用toByteArray()。它通过以4KiB为块复制字节来处理大文件。

public static byte[] getBytesFromInputStream(InputStream is) throws IOException {
    ByteArrayOutputStream os = new ByteArrayOutputStream(); 
    byte[] buffer = new byte[0xFFFF];
    for (int len = is.read(buffer); len != -1; len = is.read(buffer)) { 
        os.write(buffer, 0, len);
    }
    return os.toByteArray();
}

Java 8方式(感谢BufferedReader和Adam Bien)

private static byte[] readFully(InputStream input) throws IOException {
    try (BufferedReader buffer = new BufferedReader(new InputStreamReader(input))) {
        return buffer.lines().collect(Collectors.joining("\n")).getBytes(<charset_can_be_specified>);
    }
}

注意，这个解决方案删除回车符('\r')，可能是不合适的。

20年后，终于有了一个不需要第三方库的简单解决方案，这要感谢Java 9:

InputStream is;
…
byte[] array = is.readAllBytes();

还要注意方便的方法readNBytes(byte[] b, int off, int len)和transferTo(OutputStream)来解决重复的需求。

使用普通Java的DataInputStream和它的readFully方法(至少从Java 1.4开始存在):

...
byte[] bytes = new byte[(int) file.length()];
DataInputStream dis = new DataInputStream(new FileInputStream(file));
dis.readFully(bytes);
...

这个方法还有其他一些形式，但在这个用例中，我一直使用这个方法。