MinGW (or MinGW-w64)               Cygwin
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   Your program written        Your program written
  for Unix and GNU/Linux      for Unix and GNU/Linux

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    Heavy modifications       Almost no modifications

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             |                           |
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        Compilation                 Compilation

Program compiled with Cygwin ---> Compatibility layer ---> Windows API

Program compiled with MinGW (or MingGW-w64) -------------> Windows API

要在非免费/专有/闭源应用程序中使用Cygwin，您需要向Red Hat支付数万美元的“许可证买断”;这会使标准许可条款失效，并付出相当大的代价。谷歌“cygwin许可证成本”，并看到前几个结果。

对于mingw，不产生这种成本，并且许可证(PD、BSD、MIT)是非常允许的。您最多可能需要在应用程序中提供许可细节，例如使用mingw64-tdm时所需的winpthreads许可。

由Izzy Helianthus提供的编辑:商业许可证不再可用，也不再需要，因为Cygwin的winsup子目录中的API库现在是在LGPL下发布的，而不是完全的GPL。

Cygwin模拟整个POSIX环境，而MinGW是仅用于编译的最小工具集(编译本地Win应用程序)。所以，如果你想让你的项目跨平台，MinGW显然是两个选择之一。

尽管你可能会考虑在Windows上使用VS，在Linux/ unix上使用GCC。大多数开源项目都这样做(例如Firefox或Python)。

Cygwin使用一个DLL, Cygwin . DLL，(或者可能是一组DLL)在Windows上提供类似posix的运行时。

MinGW编译为本地Win32应用程序。

如果您使用Cygwin构建某个东西，那么您安装它的任何系统也将需要Cygwin DLL。MinGW应用程序不需要任何特殊的运行时。

其他答案已经击中了目标。我只是想增加一个快速捕捉的例子。

请注意，两者之间的效用行为确实不同。

例如，Cygwin tar可以fork -，因为DLL中支持fork()，而mingw版本则不支持。当试图从源代码编译mysql时，这是一个问题。