Cygwin使用兼容层，而MinGW是本地的。这是主要的区别之一。

Cygwin模拟整个POSIX环境，而MinGW是仅用于编译的最小工具集(编译本地Win应用程序)。所以，如果你想让你的项目跨平台，MinGW显然是两个选择之一。

尽管你可能会考虑在Windows上使用VS，在Linux/ unix上使用GCC。大多数开源项目都这样做(例如Firefox或Python)。

其他答案已经击中了目标。我只是想增加一个快速捕捉的例子。

Cygwin使用一个DLL, Cygwin . DLL，(或者可能是一组DLL)在Windows上提供类似posix的运行时。

MinGW编译为本地Win32应用程序。

如果您使用Cygwin构建某个东西，那么您安装它的任何系统也将需要Cygwin DLL。MinGW应用程序不需要任何特殊的运行时。

Cygwin使用兼容层，而MinGW是本地的。这是主要的区别之一。

不要忽视AT&T的U/Win软件，该软件旨在帮助您在windows上编译Unix应用程序(最新版本- 2012-08-06;使用Eclipse公共许可证，版本1.0)。

像Cygwin一样，他们必须与图书馆赛跑;在它们的情况下是POSIX.DLL。AT&T的人都是很棒的工程师(同样的团队给你带来了ksh和dot)，他们的东西值得一看。