我想找到有“abc”和“efg”的文件,这两个字符串在该文件中的不同行。一个包含以下内容的文件:
blah blah..
blah blah..
blah abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg blah blah
blah blah..
blah blah..
应该匹配。
我想找到有“abc”和“efg”的文件,这两个字符串在该文件中的不同行。一个包含以下内容的文件:
blah blah..
blah blah..
blah abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg blah blah
blah blah..
blah blah..
应该匹配。
当前回答
如果您愿意使用上下文,这可以通过输入来实现
grep -A 500 abc test.txt | grep -B 500 efg
这将显示“abc”和“efg”之间的所有内容,只要它们之间的距离不超过500行。
其他回答
用银搜索器:
ag 'abc.*(\n|.)*efg' your_filename
与戒指持有者的答案相似,但用ag代替。银色搜索者的速度优势可能在这里大放异彩。
我用它从一个multi fasta文件中提取一个fasta序列,使用grep的-P选项:
grep -Pzo ">tig00000034[^>]+" file.fasta > desired_sequence.fasta
基于perl的搜索 Z表示行以0字节结尾,而不是换行字符 O来捕获匹配的内容,因为grep返回整行(在本例中,因为您做了-z是整个文件)。
regexp的核心是[^>],它翻译为“不大于符号”。
下面是一种连续使用两个grep的方法:
egrep -o 'abc|efg' $file | grep -A1 abc | grep efg | wc -l
返回0或正整数。
egrep -o(只显示匹配,技巧:同一行上的多个匹配会产生多行输出,就好像它们在不同的行上一样)
grep -A1 abc(打印abc及其后面的行) Grep efg | wc -l(在ABC之后的相同或后面的行中发现的efg行数为0-n,结果可用于'if") 如果需要模式匹配,可以将Grep更改为egrep等
#!/bin/bash
shopt -s nullglob
for file in *
do
r=$(awk '/abc/{f=1}/efg/{g=1;exit}END{print g&&f ?1:0}' file)
if [ "$r" -eq 1 ];then
echo "Found pattern in $file"
else
echo "not found"
fi
done
这应该可以工作:
cat FILE | egrep 'abc|efg'
如果有多个匹配项,可以使用grep -v过滤掉