我知道我可以实现这样一个均方根误差函数:

def rmse(predictions, targets):
    return np.sqrt(((predictions - targets) ** 2).mean())

如果这个rmse函数是在某个库中实现的,可能是在scipy或scikit-learn中,我在寻找什么?


当前回答

基准

对于不需要开销处理程序并且总是期望numpy数组输入的特定用例,最快的方法是手动在numpy中编写函数。更重要的是,如果频繁调用它,可以使用numba来加快速度。

import numpy as np
from numba import jit
from sklearn.metrics import mean_squared_error
%%timeit
mean_squared_error(y[i],y[j], squared=False)
445 µs ± 90.6 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
def euclidian_distance(y1, y2):
    """
    RMS Euclidean method
    """
    return np.sqrt(((y1-y2)**2).mean())
%%timeit
euclidian_distance(y[i],y[j])
28.8 µs ± 2.54 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10000 loops each)
@jit(nopython=True)
def jit_euclidian_distance(y1, y2):
    """
    RMS Euclidean method
    """
    return np.sqrt(((y1-y2)**2).mean())
%%timeit
jit_euclidian_distance(y[i],y[j])
2.1 µs ± 234 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100000 loops each)
@jit(nopython=True)
def jit2_euclidian_distance(y1, y2):
    """
    RMS Euclidean method
    """
    return np.linalg.norm(y1-y2)/np.sqrt(y1.shape[0])
%%timeit
jit2_euclidian_distance(y[i],y[j])
2.67 µs ± 60.8 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100000 loops each)

额外注意:在我的用例中,numba在np.sqrt(((y1-y2)**2).mean()上给出的结果略有不同,但可以忽略不计,其中没有numba,结果将等于scipy结果。你自己试试。

其他回答

你可能想加上绝对值np。如果你在处理复数。

import numpy as np
rms = np.sqrt(np.mean(np.abs(x-y)**2))

注意,如果使用np. linalgg .norm,它已经处理了复数。

import numpy as np
rms = np.linalg.norm(x-y)/np.sqrt(len(x))

是的,它是由SKLearn提供的,我们只需要在参数中提到平方= False

from sklearn.metrics import mean_squared_error

mean_squared_error(y_true, y_pred, squared=False)

这个可能更快?:

n = len(predictions)
rmse = np.linalg.norm(predictions - targets) / np.sqrt(n)

Sklearn >= 0.22.0

sklearn。metrics有一个带有平方kwarg的mean_squared_error函数(默认为True)。将平方设置为False将返回RMSE。

from sklearn.metrics import mean_squared_error

rms = mean_squared_error(y_actual, y_predicted, squared=False)

Sklearn < 0.22.0

sklearn。Metrics有一个mean_squared_error函数。RMSE就是它返回值的平方根。

from sklearn.metrics import mean_squared_error
from math import sqrt

rms = sqrt(mean_squared_error(y_actual, y_predicted))

在scikit-learn 0.22.0中,您可以将参数squared=False传递给mean_squared_error()以返回RMSE。

from sklearn.metrics import mean_squared_error
mean_squared_error(y_actual, y_predicted, squared=False)