是否有一种直接的方法将CSV文件的内容导入到记录数组中,就像R的read.table(), read.delim()和read.csv()将数据导入到R数据框架中一样?
或者我应该使用csv.reader(),然后应用numpy.core.records.fromrecords()?
是否有一种直接的方法将CSV文件的内容导入到记录数组中,就像R的read.table(), read.delim()和read.csv()将数据导入到R数据框架中一样?
或者我应该使用csv.reader(),然后应用numpy.core.records.fromrecords()?
当前回答
还可以尝试recfromcsv(),它可以猜测数据类型并返回正确格式化的记录数组。
其他回答
还可以尝试recfromcsv(),它可以猜测数据类型并返回正确格式化的记录数组。
使用numpy.genfromtxt(),将分隔符kwarg设置为逗号:
from numpy import genfromtxt
my_data = genfromtxt('my_file.csv', delimiter=',')
我建议使用表(pip3 install tables)。您可以使用pandas将.csv文件保存到.h5。
import pandas as pd
data = pd.read_csv("dataset.csv")
store = pd.HDFStore('dataset.h5')
store['mydata'] = data
store.close()
然后,即使是大量的数据,您也可以轻松地用更少的时间将数据加载到NumPy数组中。
import pandas as pd
store = pd.HDFStore('dataset.h5')
data = store['mydata']
store.close()
# Data in NumPy format
data = data.values
使用pandas.read_csv:
import pandas as pd
df = pd.read_csv('myfile.csv', sep=',', header=None)
print(df.values)
array([[ 1. , 2. , 3. ],
[ 4. , 5.5, 6. ]])
这就提供了一个pandas DataFrame,它提供了许多numpy记录数组无法直接提供的有用的数据操作函数。
DataFrame是一个2维标记数据结构,列为 可能是不同的类型。你可以把它想象成一个电子表格 SQL表……
我还推荐numpy.genfromtxt。然而,由于问题要求的是记录数组,而不是普通数组,因此需要在genfromtxt调用中添加dtype=None参数:
import numpy as np
np.genfromtxt('myfile.csv', delimiter=',')
对于下面的'myfile.csv':
1.0, 2, 3
4, 5.5, 6
上面的代码给出了一个数组:
array([[ 1. , 2. , 3. ],
[ 4. , 5.5, 6. ]])
and
np.genfromtxt('myfile.csv', delimiter=',', dtype=None)
给出一个记录数组:
array([(1.0, 2.0, 3), (4.0, 5.5, 6)],
dtype=[('f0', '<f8'), ('f1', '<f8'), ('f2', '<i4')])
这样做的好处是可以轻松导入具有多种数据类型(包括字符串)的文件。
In [329]: %time my_data = genfromtxt('one.csv', delimiter=',')
CPU times: user 19.8 s, sys: 4.58 s, total: 24.4 s
Wall time: 24.4 s
In [330]: %time df = pd.read_csv("one.csv", skiprows=20)
CPU times: user 1.06 s, sys: 312 ms, total: 1.38 s
Wall time: 1.38 s