超过30个答案，但我用了不同的方法。

我有两个独立的项目。一个Windows服务，和一个Windows窗体应用程序。应用程序引用WS项目，两者都引用SQLite核心nuget包。

在构建WS项目时，有x64和x32文件夹。但在构建应用程序时，文件夹不会显示出来。

检查这里的答案，我不能让他们工作。但是我发现WS项目中有以下代码片段，而App项目中没有。我添加了它，现在文件夹显示正确。

<Import Project="..\packages\System.Data.SQLite.Core.1.0.112.0\build\net46\System.Data.SQLite.Core.targets" Condition="Exists('..\packages\System.Data.SQLite.Core.1.0.112.0\build\net46\System.Data.SQLite.Core.targets')" />

来自NuGet的多体系结构(x86, x64)版本SQLite的默认安装显示了您所描述的行为。如果你想加载。net运行时选择在你的机器上运行你的应用程序的实际体系结构的正确版本，那么你可以给DLL加载器一个关于在哪里找到正确库的提示，如下所示:

在Program.Main()之前添加kernel32.dll函数调用SetDLLDirectory()的声明:

    [System.Runtime.InteropServices.DllImport("kernel32.dll", CharSet = System.Runtime.InteropServices.CharSet.Unicode, SetLastError = true)]
    [return: System.Runtime.InteropServices.MarshalAs(System.Runtime.InteropServices.UnmanagedType.Bool)]
    static extern bool SetDllDirectory(string lpPathName);

然后使用您自己的方法确定正确的子目录，以找到'SQLite.Interop.dll'的特定于体系结构的版本。我使用以下代码:

    [STAThread]
    static void Main()
    {
        int wsize = IntPtr.Size;
        string libdir = (wsize == 4)?"x86":"x64";
        string appPath = System.IO.Path.GetDirectoryName(Application.ExecutablePath);
        SetDllDirectory(System.IO.Path.Combine(appPath, libdir));

在构建之前，尝试将平台目标设置为x86或x64(而不是任何CPU): 项目->属性->在Visual Studio中构建->平台目标。

我想到了一个解决办法。

在我的例子中，我使用的是Microsoft Visual Studio安装程序项目。 安装项目看不到来自主要输出的x64和x86文件夹和内容。

解决方案:

将x64和x86文件夹都添加到安装程序中的应用程序文件夹中。 添加两个文件夹的内容。

这将允许安装程序复制SQLite工作所需的DLL文件。

我在一个WebAPI/MVC5 web项目和一个特性测试项目的解决方案中遇到了这个问题，这两个项目都来自同一个数据访问(或“核心”)项目。像这里的许多人一样，我使用的是通过NuGet在Visual Studio 2013中下载的副本。

What I did, was in Visual Studio added a x86 and x64 solution folder to the Feature Test and Web Projects. I then did a Right Click | Add Existing Item..., and added the appropriate SQLite.interop.dll library from ..\SolutionFolder\packages\System.Data.SQLite.Core.1.0.94.0\build\net451\[appropriate architecture] for each of those folders. I then did a Right Click | Properties, and set Copy to Output Directory to Always Copy. The next time I needed to run my feature tests, the tests ran successfully.

复制SQLite.Interop.dll到项目目录。

src\
  project\
      bin\   <-- Past in bin
         x64\
           SQLite.Interop.dll <-- Copy this if 64
         x86\
           SQLite.Interop.dll <-- Copy this if 32