sink(file = 'R.log', split=T)

options(scipen=5)

.ls.objects <- function (pos = 1, pattern, order.by = "Size", decreasing=TRUE, head =     TRUE, n = 10) {
  # based on postings by Petr Pikal and David Hinds to the r-help list in 2004
  # modified by: Dirk Eddelbuettel (http://stackoverflow.com/questions/1358003/tricks-to-    manage-the-available-memory-in-an-r-session) 
  # I then gave it a few tweaks (show size as megabytes and use defaults that I like)
  # a data frame of the objects and their associated storage needs.
  napply <- function(names, fn) sapply(names, function(x)
          fn(get(x, pos = pos)))
  names <- ls(pos = pos, pattern = pattern)
  obj.class <- napply(names, function(x) as.character(class(x))[1])
  obj.mode <- napply(names, mode)
  obj.type <- ifelse(is.na(obj.class), obj.mode, obj.class)
  obj.size <- napply(names, object.size) / 10^6 # megabytes
  obj.dim <- t(napply(names, function(x)
            as.numeric(dim(x))[1:2]))
  vec <- is.na(obj.dim)[, 1] & (obj.type != "function")
  obj.dim[vec, 1] <- napply(names, length)[vec]
  out <- data.frame(obj.type, obj.size, obj.dim)
  names(out) <- c("Type", "Size", "Rows", "Columns")
  out <- out[order(out[[order.by]], decreasing=decreasing), ]
  if (head)
    out <- head(out, n)
  out
}

我喜欢保存我的R命令历史，并在每次运行R命令时都可用:

在shell或.bashrc中:

export R_HISTFILE=~/.Rhistory

在.Rprofile:

.Last <- function() {
        if (!any(commandArgs()=='--no-readline') && interactive()){
                require(utils)
                try(savehistory(Sys.getenv("R_HISTFILE")))
        }
}

我发现两个函数是非常必要的:首先，当我在几个函数上设置debug()并且我已经解决了错误，所以我想要undebug()所有函数-而不是一个接一个。在这里添加的undebug_all()函数作为接受的答案是最好的。

其次，当我定义了许多函数并正在寻找一个特定的变量名时，很难在ls()的所有结果中找到它，包括函数名。这里发布的lsnofun()函数真的很好。

这是我的想法，包括上面提到的一些想法。

你可能需要看两件事:

.set.width() / w()将打印宽度更新为其中一个终端。不幸的是，我没有找到一种方法在终端调整大小上自动做到这一点- R文档提到这是由一些R解释器完成的。 每次都会保存历史记录，并保存时间戳和工作目录

.

.set.width <- function() {
  cols <- as.integer(Sys.getenv("COLUMNS"))
  if (is.na(cols) || cols > 10000 || cols < 10)
    options(width=100)
  options(width=cols)
}

.First <- function() {
  options(digits.secs=3)              # show sub-second time stamps
  options(max.print=1000)             # do not print more than 1000 lines
  options("report" = c(CRAN="http://cran.at.r-project.org"))
  options(prompt="R> ", digits=4, show.signif.stars=FALSE)
}

# aliases
w <- .set.width

.Last <- function() {
  if (!any(commandArgs()=='--no-readline') && interactive()){
    timestamp(,prefix=paste("##------ [",getwd(),"] ",sep=""))
    try(savehistory("~/.Rhistory"))
   }
}

这是我的~/。Rprofile，为Mac和Linux设计。

这使得错误更容易被发现。

options(showWarnCalls=T, showErrorCalls=T)

我讨厌CRAN菜单选择，所以设置一个好的。

options(repos=c("http://cran.cnr.Berkeley.edu","http://cran.stat.ucla.edu"))

更多的历史!

Sys.setenv(R_HISTSIZE='100000')

下面是从终端在Mac OSX上运行的(我更喜欢R.app，因为它更稳定，你可以通过目录来组织你的工作;还要确保得到一个好的~/.inputrc)。默认情况下，你会得到一个X11显示，这看起来不太好;这反而给出了一个与GUI相同的石英显示。if语句应该在Mac上从终端运行R时捕获这种情况。

f = pipe("uname")
if (.Platform$GUI == "X11" && readLines(f)=="Darwin") {
  # http://www.rforge.net/CarbonEL/
  library("grDevices")
  library("CarbonEL")
  options(device='quartz')
  Sys.unsetenv("DISPLAY")
}
close(f); rm(f)

并预加载一些库，

library(plyr)
library(stringr)
library(RColorBrewer)
if (file.exists("~/util.r")) {
  source("~/util.r")
}

跑龙套的地方。r是我在通量下随机选取的一袋东西。

此外，由于其他人提到了控制台宽度，以下是我如何做到这一点。

if ( (numcol <-Sys.getenv("COLUMNS")) != "") {
  numcol = as.integer(numcol)
  options(width= numcol - 1)
} else if (system("stty -a &>/dev/null") == 0) {
  # mac specific?  probably bad in the R GUI too.
  numcol = as.integer(sub(".* ([0-9]+) column.*", "\\1", system("stty -a", intern=T)[1]))
  if (numcol > 0)
    options(width=  numcol - 1 )
}
rm(numcol)

这实际上不在. rprofile中，因为每次调整终端窗口大小时都必须重新运行它。我有它在util。r那么我只是在必要的时候引用它。

我使用下面的方法让cacheSweave(或pgfSweave)在RStudio中使用“Compile PDF”按钮:

library(cacheSweave)
assignInNamespace("RweaveLatex", cacheSweave::cacheSweaveDriver, "utils")