我有一个DataFrame,在列中有许多缺失的值,我希望通过分组:

import pandas as pd
import numpy as np
df = pd.DataFrame({'a': ['1', '2', '3'], 'b': ['4', np.NaN, '6']})

In [4]: df.groupby('b').groups
Out[4]: {'4': [0], '6': [2]}

看到Pandas已经删除了具有NaN目标值的行。(我想包括这些行!)

因为我需要很多这样的操作(许多cols有缺失的值),并且使用比中位数更复杂的函数(通常是随机森林),所以我希望避免编写过于复杂的代码段。

有什么建议吗?我应该写一个函数还是有简单的解决方案?


当前回答

我已经回答了这个问题,但由于某些原因,答案被转换为评论。然而,这是最有效的解决方案:

不能在组中包含(和传播)nan是相当严重的。引用R是没有说服力的,因为这种行为与许多其他事情不一致。不管怎样,虚拟黑客也很糟糕。但是,如果组中存在nan,则组的大小(包括nan)和计数(忽略nan)会有所不同。

dfgrouped = df.groupby(['b']).a.agg(['sum','size','count'])

dfgrouped['sum'][dfgrouped['size']!=dfgrouped['count']] = None

当这些值不同时,您可以将该组的聚合函数结果的值设置为None。

其他回答

我不能给M. Kiewisch添加评论,因为我没有足够的声誉点(只有41点,但需要超过50点来评论)。

不管怎样,只是想指出M. Kiewisch解决方案并不管用,可能需要更多的调整。举个例子

>>> df = pd.DataFrame({'a': [1, 2, 3, 5], 'b': [4, np.NaN, 6, 4]})
>>> df
   a    b
0  1  4.0
1  2  NaN
2  3  6.0
3  5  4.0
>>> df.groupby(['b']).sum()
     a
b
4.0  6
6.0  3
>>> df.astype(str).groupby(['b']).sum()
      a
b
4.0  15
6.0   3
nan   2

这表明对于b=4.0组,对应的值是15而不是6。这里只是将1和5作为字符串连接起来,而不是作为数字相加。

我已经回答了这个问题,但由于某些原因,答案被转换为评论。然而,这是最有效的解决方案:

不能在组中包含(和传播)nan是相当严重的。引用R是没有说服力的,因为这种行为与许多其他事情不一致。不管怎样,虚拟黑客也很糟糕。但是,如果组中存在nan,则组的大小(包括nan)和计数(忽略nan)会有所不同。

dfgrouped = df.groupby(['b']).a.agg(['sum','size','count'])

dfgrouped['sum'][dfgrouped['size']!=dfgrouped['count']] = None

当这些值不同时,您可以将该组的聚合函数结果的值设置为None。

古老的话题,如果有人仍然在这个问题上绊倒-另一个解决方案是在分组之前通过.astype(str)转换为字符串。这样可以保存NaN。

df = pd.DataFrame({'a': ['1', '2', '3'], 'b': ['4', np.NaN, '6']})
df['b'] = df['b'].astype(str)
df.groupby(['b']).sum()
    a
b   
4   1
6   3
nan 2

熊猫>= 1.1

从熊猫1.1你可以更好地控制这种行为,现在允许NA值在石斑鱼使用dropna=False:

pd.__version__
# '1.1.0.dev0+2004.g8d10bfb6f'

# Example from the docs
df

   a    b  c
0  1  2.0  3
1  1  NaN  4
2  2  1.0  3
3  1  2.0  2

# without NA (the default)
df.groupby('b').sum()

     a  c
b        
1.0  2  3
2.0  2  5
# with NA
df.groupby('b', dropna=False).sum()

     a  c
b        
1.0  2  3
2.0  2  5
NaN  1  4

在文档的缺失数据部分提到了这一点:

“GroupBy”中的NA组被自动排除。这个行为与R一致

一个解决方法是在执行groupby(例如-1)之前使用占位符:

In [11]: df.fillna(-1)
Out[11]: 
   a   b
0  1   4
1  2  -1
2  3   6

In [12]: df.fillna(-1).groupby('b').sum()
Out[12]: 
    a
b    
-1  2
4   1
6   3

也就是说,这感觉很糟糕……也许应该有一个选项,包括NaN在groupby(见这个github问题-它使用相同的占位符黑客)。

然而,正如另一个答案所描述的,“从熊猫1.1中,你可以更好地控制这种行为,现在允许在石斑鱼中使用dropna=False的NA值”