我有一个包含因子的数据帧。当我使用子集或其他索引函数创建这个数据帧的子集时,就创建了一个新的数据帧。然而,因子变量保留其所有原始水平,即使它们不存在于新的数据框架中。

这在绘制面图或使用依赖于因子级别的函数时会导致问题。

在新的数据框架中从一个因子中移除级别最简洁的方法是什么?

这里有一个例子:

df <- data.frame(letters=letters[1:5],
                    numbers=seq(1:5))

levels(df$letters)
## [1] "a" "b" "c" "d" "e"

subdf <- subset(df, numbers <= 3)
##   letters numbers
## 1       a       1
## 2       b       2
## 3       c       3    

# all levels are still there!
levels(subdf$letters)
## [1] "a" "b" "c" "d" "e"

当前回答

一个真正的droplevels函数是collapse::fdroplevels,它比droplevels快得多,并且不执行任何不必要的匹配或数值制表。例子:

library(collapse)
library(microbenchmark)

# wlddev data supplied in collapse, iso3c is a factor
data <- fsubset(wlddev, iso3c %!in% "USA")

microbenchmark(fdroplevels(data), droplevels(data), unit = "relative")
## Unit: relative
##               expr  min       lq     mean   median       uq      max neval cld
##  fdroplevels(data)  1.0  1.00000  1.00000  1.00000  1.00000  1.00000   100  a 
##   droplevels(data) 30.2 29.15873 24.54175 24.86147 22.11553 14.23274   100   b

其他回答

一个真正的droplevels函数是collapse::fdroplevels,它比droplevels快得多,并且不执行任何不必要的匹配或数值制表。例子:

library(collapse)
library(microbenchmark)

# wlddev data supplied in collapse, iso3c is a factor
data <- fsubset(wlddev, iso3c %!in% "USA")

microbenchmark(fdroplevels(data), droplevels(data), unit = "relative")
## Unit: relative
##               expr  min       lq     mean   median       uq      max neval cld
##  fdroplevels(data)  1.0  1.00000  1.00000  1.00000  1.00000  1.00000   100  a 
##   droplevels(data) 30.2 29.15873 24.54175 24.86147 22.11553 14.23274   100   b

不幸的是,factor()在使用RevoScaleR的rxDataStep时似乎不起作用。我分两步做: 1)转换为字符并存储在临时外部数据帧(.xdf)。 2)转换回因子并存储在确定的外部数据帧中。这消除了任何未使用的因子级别,而无需将所有数据加载到内存中。

# Step 1) Converts to character, in temporary xdf file:
rxDataStep(inData = "input.xdf", outFile = "temp.xdf", transforms = list(VAR_X = as.character(VAR_X)), overwrite = T)
# Step 2) Converts back to factor:
rxDataStep(inData = "temp.xdf", outFile = "output.xdf", transforms = list(VAR_X = as.factor(VAR_X)), overwrite = T)

已经尝试了这里的大多数例子,如果不是全部,但似乎没有一个在我的情况下工作。 经过相当一段时间的斗争,我尝试使用as.character()在因子列上将其更改为带有字符串的col,这似乎工作得很好。

不确定性能问题。

查看R源代码中的droplevels方法代码,您可以看到它包装为因子函数。这意味着你基本上可以用因子函数重新创建列。 下面是数据。从所有因子列中删除级别的表方式。

library(data.table)
dt = data.table(letters=factor(letters[1:5]), numbers=seq(1:5))
levels(dt$letters)
#[1] "a" "b" "c" "d" "e"
subdt = dt[numbers <= 3]
levels(subdt$letters)
#[1] "a" "b" "c" "d" "e"

upd.cols = sapply(subdt, is.factor)
subdt[, names(subdt)[upd.cols] := lapply(.SD, factor), .SDcols = upd.cols]
levels(subdt$letters)
#[1] "a" "b" "c"

我写了效用函数来做这个。现在我知道了gdata的drop。水平,看起来很相似。他们在这里(从这里):

present_levels <- function(x) intersect(levels(x), x)

trim_levels <- function(...) UseMethod("trim_levels")

trim_levels.factor <- function(x)  factor(x, levels=present_levels(x))

trim_levels.data.frame <- function(x) {
  for (n in names(x))
    if (is.factor(x[,n]))
      x[,n] = trim_levels(x[,n])
  x
}