我有一个包含因子的数据帧。当我使用子集或其他索引函数创建这个数据帧的子集时,就创建了一个新的数据帧。然而,因子变量保留其所有原始水平,即使它们不存在于新的数据框架中。

这在绘制面图或使用依赖于因子级别的函数时会导致问题。

在新的数据框架中从一个因子中移除级别最简洁的方法是什么?

这里有一个例子:

df <- data.frame(letters=letters[1:5],
                    numbers=seq(1:5))

levels(df$letters)
## [1] "a" "b" "c" "d" "e"

subdf <- subset(df, numbers <= 3)
##   letters numbers
## 1       a       1
## 2       b       2
## 3       c       3    

# all levels are still there!
levels(subdf$letters)
## [1] "a" "b" "c" "d" "e"

当前回答

查看R源代码中的droplevels方法代码,您可以看到它包装为因子函数。这意味着你基本上可以用因子函数重新创建列。 下面是数据。从所有因子列中删除级别的表方式。

library(data.table)
dt = data.table(letters=factor(letters[1:5]), numbers=seq(1:5))
levels(dt$letters)
#[1] "a" "b" "c" "d" "e"
subdt = dt[numbers <= 3]
levels(subdt$letters)
#[1] "a" "b" "c" "d" "e"

upd.cols = sapply(subdt, is.factor)
subdt[, names(subdt)[upd.cols] := lapply(.SD, factor), .SDcols = upd.cols]
levels(subdt$letters)
#[1] "a" "b" "c"

其他回答

这是一个已知的问题,您的示例所在的gdata包中的drop.levels()提供了一个可能的补救措施

> drop.levels(subdf)
  letters numbers
1       a       1
2       b       2
3       c       3
> levels(drop.levels(subdf)$letters)
[1] "a" "b" "c"

在Hmisc包中还有一个dropUnusedLevels函数。但是,它只能通过修改子集操作符[来工作,在这里不适用。

因此,基于每列的直接方法是简单的As .factor(As .character(data)):

> levels(subdf$letters)
[1] "a" "b" "c" "d" "e"
> subdf$letters <- as.factor(as.character(subdf$letters))
> levels(subdf$letters)
[1] "a" "b" "c"

一个真正的droplevels函数是collapse::fdroplevels,它比droplevels快得多,并且不执行任何不必要的匹配或数值制表。例子:

library(collapse)
library(microbenchmark)

# wlddev data supplied in collapse, iso3c is a factor
data <- fsubset(wlddev, iso3c %!in% "USA")

microbenchmark(fdroplevels(data), droplevels(data), unit = "relative")
## Unit: relative
##               expr  min       lq     mean   median       uq      max neval cld
##  fdroplevels(data)  1.0  1.00000  1.00000  1.00000  1.00000  1.00000   100  a 
##   droplevels(data) 30.2 29.15873 24.54175 24.86147 22.11553 14.23274   100   b

谢谢你提出这个问题。然而,以上的解决方案都不适合我。我为这个问题做了一个变通方案,分享它以防其他人偶然发现这个问题:

对于所有包含值为零的级别的因子列,您可以先将这些列转换为字符类型,然后再将它们转换回因子。

对于上面的问题,只需添加以下代码行:

# Convert into character
subdf$letters = as.character(subdf$letters)

# Convert back into factor
subdf$letters = as.factor(subdf$letters)

# Verify the levels in the subset
levels(subdf$letters)

非常有趣的话题,我特别喜欢因子子选择的想法。我以前遇到过类似的问题,我只是转换成字符,然后再转换回因子。

   df <- data.frame(letters=letters[1:5],numbers=seq(1:5))
   levels(df$letters)
   ## [1] "a" "b" "c" "d" "e"
   subdf <- df[df$numbers <= 3]
   subdf$letters<-factor(as.character(subdf$letters))

另一种方法,但使用dplyr

library(dplyr)
subdf <- df %>% filter(numbers <= 3) %>% droplevels()
str(subdf)

编辑:

同样有效!感谢agenis

subdf <- df %>% filter(numbers <= 3) %>% droplevels
levels(subdf$letters)