有人知道如何从R中的data。frame中移除一整列吗?例如,如果我得到这个data.frame:

> head(data)
   chr       genome region
1 chr1 hg19_refGene    CDS
2 chr1 hg19_refGene   exon
3 chr1 hg19_refGene    CDS
4 chr1 hg19_refGene   exon
5 chr1 hg19_refGene    CDS
6 chr1 hg19_refGene   exon

我想去掉第二列。


当前回答

发布的答案在使用data.frames时非常好。然而,从内存的角度来看,这些任务的效率非常低。对于大数据,删除列可能需要异常长的时间和/或由于内存不足错误而失败。包数据。Table使用:=操作符帮助解决这个问题:

library(data.table)
> dt <- data.table(a = 1, b = 1, c = 1)
> dt[,a:=NULL]
     b c
[1,] 1 1

我应该用一个更大的例子来说明差异。我会在某个时候更新这个答案。

其他回答

(为了完整性)如果你想按名称删除列,你可以这样做:

cols.dont.want <- "genome"
cols.dont.want <- c("genome", "region") # if you want to remove multiple columns

data <- data[, ! names(data) %in% cols.dont.want, drop = F]

包含drop = F可以确保结果仍然是data.frame,即使只剩下一列。

使用dplyR,以下工作:

数据<- select(Data, -genome)

根据这里找到的文件https://www.marsja.se/how-to-remove-a-column-in-r-using-dplyr-by-name-and-index/#:~:text=select(starwars%2C%20%2Dheight)

发布的答案在使用data.frames时非常好。然而,从内存的角度来看,这些任务的效率非常低。对于大数据,删除列可能需要异常长的时间和/或由于内存不足错误而失败。包数据。Table使用:=操作符帮助解决这个问题:

library(data.table)
> dt <- data.table(a = 1, b = 1, c = 1)
> dt[,a:=NULL]
     b c
[1,] 1 1

我应该用一个更大的例子来说明差异。我会在某个时候更新这个答案。

要按名称删除一个或多个列,如果列名是已知的(而不是在运行时确定的),我喜欢使用子集()语法。例如,对于数据帧

df <- data.frame(a=1:3, d=2:4, c=3:5, b=4:6)

你可以去掉a列

Data <- subset( Data, select = -a )

要去掉b和d列,你可以这么做

Data <- subset( Data, select = -c(d, b ) )

你可以删除d和b之间的所有列:

Data <- subset( Data, select = -c( d : b )

如上所述,此语法仅在列名已知的情况下有效。当以编程方式确定列名(即赋值给变量)时,它将不起作用。我将从?子集文档中复制这个警告:

警告: 这是一个方便交互使用的功能。 对于编程,最好使用标准子集 像'['这样的函数,特别是非标准求值 的论点“子集”可能会产生意想不到的后果。

您可以将其设置为NULL。

> Data$genome <- NULL
> head(Data)
   chr region
1 chr1    CDS
2 chr1   exon
3 chr1    CDS
4 chr1   exon
5 chr1    CDS
6 chr1   exon

正如评论中所指出的,这里有一些其他的可能性:

Data[2] <- NULL    # Wojciech Sobala
Data[[2]] <- NULL  # same as above
Data <- Data[,-2]  # Ian Fellows
Data <- Data[-2]   # same as above

你可以通过以下方法删除多个列:

Data[1:2] <- list(NULL)  # Marek
Data[1:2] <- NULL        # does not work!

但是要小心矩阵子集的设置,因为你最终会得到一个向量:

Data <- Data[,-(2:3)]             # vector
Data <- Data[,-(2:3),drop=FALSE]  # still a data.frame