是否可以在Python中读取二进制MATLAB .mat文件?
我看到SciPy声称支持读取.mat文件,但我没有成功。我安装了SciPy 0.7.0版本,但找不到loadmat()方法。
是否可以在Python中读取二进制MATLAB .mat文件?
我看到SciPy声称支持读取.mat文件,但我没有成功。我安装了SciPy 0.7.0版本,但找不到loadmat()方法。
当前回答
还有MathWorks本身的Python MATLAB引擎。如果你有MATLAB,这可能值得考虑(我自己没有尝试过,但它有很多功能,而不仅仅是读取MATLAB文件)。然而,我不知道是否允许将其分发给其他用户(如果这些人拥有MATLAB,这可能不是问题。否则,也许NumPy才是正确的选择?)
此外,如果您想自己完成所有的基础工作,MathWorks提供了关于文件格式结构的详细文档(如果链接更改,请尝试谷歌获取matfile_format.pdf或其标题MAT-FILE Format)。这并不像我个人想的那么复杂,但显然,这不是最简单的方法。这也取决于你想要支持多少个.mat文件的特性。
我写了一个“小”(大约700行)的Python脚本,它可以读取一些基本的.mat文件。我既不是Python专家,也不是初学者,我花了大约两天时间来编写它(使用上面链接的MathWorks文档)。我学到了很多新东西,而且很有趣(大部分时间)。由于Python脚本是我在工作中编写的,恐怕我不能发布它…但我可以在这里给出一些建议:
首先阅读文档。 使用十六进制编辑器(如HxD)并查看您想要解析的引用.mat文件。 通过将字节保存到.txt文件中并注释每行来尝试找出每个字节的含义。 使用类保存每个数据元素(如miCOMPRESSED、miMATRIX、mxDOUBLE或miINT32) .mat-files的结构是保存树形数据结构中的数据元素的最佳结构;每个节点有一个类和一个子节点
其他回答
除了v4 (Level 1.0), v6, v7到7.2 matfiles和h5py. io.loadmat之外。文件7.3格式matfiles,有另一种类型的matfiles在文本数据格式而不是二进制,通常由Octave创建,这甚至不能在MATLAB中读取。
scipy.io.loadmat和h5py。文件不能加载它们(在scipy 1.5.3和h5py 3.1.0上测试),我找到的唯一解决方案是numpy.loadtxt。
import numpy as np
mat = np.loadtxt('xxx.mat')
读取文件
import scipy.io
mat = scipy.io.loadmat(file_name)
检查MAT变量的类型
print(type(mat))
#OUTPUT - <class 'dict'>
字典中的键是MATLAB变量,值是分配给这些变量的对象。
有一个很好的包叫做mat4py,可以很容易地安装使用
pip install mat4py
使用起来很简单(来自网站):
从mat文件加载数据
函数loadmat只使用Python的dict和list对象,将mat文件中存储的所有变量加载到一个简单的Python数据结构中。数值数组和单元格数组转换为行顺序的嵌套列表。压缩数组以消除只有一个元素的数组。生成的数据结构由与JSON格式兼容的简单类型组成。
示例:将mat文件加载到Python数据结构中:
from mat4py import loadmat
data = loadmat('datafile.mat')
变量数据是mat文件中包含变量和值的字典。
将Python数据结构保存到mat文件中
使用savemat函数,可以将Python数据保存到mat文件中。数据必须以与loadmat相同的方式结构化,即它应该由简单的数据类型组成,如dict, list, str, int和float。
示例:将Python数据结构保存到mat文件中:
from mat4py import savemat
savemat('datafile.mat', data)
参数数据应与变量一致。
首先将.mat文件保存为:
save('test.mat', '-v7')
之后,在Python中,使用常用的loadmat函数:
import scipy.io as sio
test = sio.loadmat('test.mat')
from os.path import dirname, join as pjoin
import scipy.io as sio
data_dir = pjoin(dirname(sio.__file__), 'matlab', 'tests', 'data')
mat_fname = pjoin(data_dir, 'testdouble_7.4_GLNX86.mat')
mat_contents = sio.loadmat(mat_fname)
你可以使用上面的代码来读取Python中默认保存的.mat文件。