正确的解决方案是将环境变量R_LIBS_USER设置为所需库文件夹的文件路径值，而不是让RStudio识别Rprofile。网站文件。

要在Windows中设置环境变量R_LIBS_USER，请进入控制面板(系统属性->高级系统属性->环境变量->用户变量)到所需的值(库文件夹的路径)，例如:

Variable name: R_LIBS_USER 
Variable value: C:/software/Rpackages  

如果由于某种原因您无法访问控制面板，您可以尝试运行rundll32 sysdm。cpl,EditEnvironmentVariables在Windows上的命令行，并从那里添加环境变量。

设置R_LIBS_USER将确保库首先显示在. libpaths()中，无论直接启动RStudio还是通过右键单击文件并“打开与”来启动RStudio。

如果总是通过单击RStudio快捷方式启动RStudio，那么Rprofile解决方案就可以工作。在这种情况下，将默认工作目录设置为存放Rprofile的目录就足够了。当单击一个文件启动RStudio时，Rprofile解决方案不起作用，因为这会将工作目录从默认的工作目录更改。

只需将R库的默认文件夹更改为没有管理员权限的目录，例如:

.libPaths("C:/R/libs")

正确的解决方案是将环境变量R_LIBS_USER设置为所需库文件夹的文件路径值，而不是让RStudio识别Rprofile。网站文件。

要在Windows中设置环境变量R_LIBS_USER，请进入控制面板(系统属性->高级系统属性->环境变量->用户变量)到所需的值(库文件夹的路径)，例如:

Variable name: R_LIBS_USER 
Variable value: C:/software/Rpackages  

如果由于某种原因您无法访问控制面板，您可以尝试运行rundll32 sysdm。cpl,EditEnvironmentVariables在Windows上的命令行，并从那里添加环境变量。

设置R_LIBS_USER将确保库首先显示在. libpaths()中，无论直接启动RStudio还是通过右键单击文件并“打开与”来启动RStudio。

如果总是通过单击RStudio快捷方式启动RStudio，那么Rprofile解决方案就可以工作。在这种情况下，将默认工作目录设置为存放Rprofile的目录就足够了。当单击一个文件启动RStudio时，Rprofile解决方案不起作用，因为这会将工作目录从默认的工作目录更改。

我通常尝试将所有的包保存在一个库中，但是如果您想添加一个库，为什么不将新的库(必须已经存在于您的文件系统中)附加到现有的库路径中呢?

.libPaths( c( .libPaths(), "~/userLibrary") )
 # obviously this would need to be a valid file directory in your OS
 # min just happened to be on a Mac that day

或者(这将使userLibrary成为第一个放置新包的地方):

.libPaths( c( "~/userLibrary" , .libPaths() ) )

然后我得到(至少回到我最初写这篇文章的时候):

> .libPaths()
[1] "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library"
[2] "/Users/user_name/userLibrary"  

libpaths函数与大多数其他非图形函数略有不同。它通过副作用起作用。Sys. Sys。getenv和Sys。setenv报告和改变R环境变量已经被分开，但是. libpaths可以报告或改变它的目标。

关于R启动过程的信息可以在启动帮助页面上阅读，在https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200549016-Customizing-RStudio上有RStudio材料

在您的案例中，RStudio似乎不尊重Rprofile。站点设置，或者通过从RStudio默认值之一读取. rprofile设置来覆盖它们。还应该提到的是，该操作的结果还将调用的内容追加到. library和. library。站点，这就是为什么RStudio-(或任何其他IDE或网络安装-)托管的R可能会表现出不同的行为的进一步原因。

因为Sys.getenv()返回R进程的当前系统环境，你可以看到库和其他路径:

Sys.getenv()[ grep("LIB|PATH", names(Sys.getenv())) ]

存储和访问包的两个关键是(现在在Linux机器上是不同的):

R_LIBS_SITE                          /usr/local/lib/R/site-library:/usr/lib/R/site-library:/usr/lib/R/library
R_LIBS_USER                          /home/david/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5.1/
 

getwd()
# [1] "C:/Users/..../software/My R studio"

复制上面的链接，带两个倒置逗号

.libPaths(new="C:/Users/..../software/My R studio")

安装包的默认路径将更改

通过将代码放在默认工作目录下的. rprofile文件中，我设法解决了这个问题。

首先，我找到了默认工作目录的位置

> getwd()
[1] "C:/Users/me/Documents"

然后，我使用文本编辑器编写了一个简单的.Rprofile文件，其中包含以下一行

.libPaths("C:/software/Rpackages")

最后，当我启动R并运行.libPaths()时，我得到了所需的输出:

> .libPaths()
[1] "C:/software/Rpackages"               "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library"
[3] "C:/Program Files/RStudio/R/library"