从文件夹位置手动删除旧程序集，然后将引用添加到新程序集可能会有所帮助。

我也犯了同样的错误。。。在我的案例中，问题解决如下：

最初安装应用程序时，这里的人在应用程序中使用了Microsoft Enterprise Library 4.1。在前一周，我的机器被格式化了，在那之后，今天当我构建应用程序时，它给了我一个错误，即缺少企业库程序集。然后我安装了Microsoft Enterprise Library 5.0，这是我在谷歌上作为第一个搜索条目获得的。然后当我构建应用程序时，它给了我上面的错误，即找到的程序集的清单定义与程序集引用不匹配。经过大量的搜索和分析，我发现应用程序引用的是4.1.0.0，bin文件夹中的DLL版本是5.0.0.0然后我安装了Microsoft Enterprise Library 4.1。删除先前的引用（5.0）并添加4.0引用。构建应用程序（&V）。。。它奏效了。

我刚刚遇到了这个问题，问题是我的应用程序调试目录中有一个旧的.dll副本。您可能还想在那里（而不是GAC）查看是否看到它。

尝试从webConfig/appConfig中删除程序集引用

 <dependentAssembly>
        <assemblyIdentity name="System.IO" publicKeyToken="B03F5F7F11D50A3A" culture="neutral" />
        <bindingRedirect oldVersion="0.0.0.0-4.1.2.0" newVersion="4.3.0.0" />
      </dependentAssembly>

只需删除项目的bin文件夹中的内容并重新生成解决方案就解决了我的问题。

如果您遇到类似“找到的程序集的清单定义与程序集引用不匹配”的错误，并且您已经通过VS中的“项目”>“管理NuGet程序包和更新”选项卡进行了更新，那么您可以做的第一件事就是在从NuGet Gallery页面检查版本并从package Manager控制台运行以下命令后，尝试安装另一个版本的程序包：

PM> Install-Package YourPackageName -Version YourVersionNumber 
//Example
PM> Install-Package Microsoft.Extensions.FileProviders.Physical -Version 2.1.0

虽然答案和所讨论的包并没有直接关系，而且早在很久以前就有人问过它，但它是一种通用的，仍然相关，希望它能帮助一些人。