尝试将缺少的内容添加到全局程序集缓存中。

我也犯了同样的错误。。。在我的案例中，问题解决如下：

最初安装应用程序时，这里的人在应用程序中使用了Microsoft Enterprise Library 4.1。在前一周，我的机器被格式化了，在那之后，今天当我构建应用程序时，它给了我一个错误，即缺少企业库程序集。然后我安装了Microsoft Enterprise Library 5.0，这是我在谷歌上作为第一个搜索条目获得的。然后当我构建应用程序时，它给了我上面的错误，即找到的程序集的清单定义与程序集引用不匹配。经过大量的搜索和分析，我发现应用程序引用的是4.1.0.0，bin文件夹中的DLL版本是5.0.0.0然后我安装了Microsoft Enterprise Library 4.1。删除先前的引用（5.0）并添加4.0引用。构建应用程序（&V）。。。它奏效了。

在我的单元测试项目中也出现了同样的错误，导致一些测试失败。我仔细检查了我在程序集资源管理器中使用的程序集的哪个版本，并检查了运行时/依赖程序集标记的内容，发现我使用的程序集中的另一个版本仍然在那里被引用。因为这是我的测试项目app.config中的唯一指令，所以我尝试删除整个app.config文件，重新构建解决方案，这就成功了！我没有更多参考错误：）

如果您遇到类似“找到的程序集的清单定义与程序集引用不匹配”的错误，并且您已经通过VS中的“项目”>“管理NuGet程序包和更新”选项卡进行了更新，那么您可以做的第一件事就是在从NuGet Gallery页面检查版本并从package Manager控制台运行以下命令后，尝试安装另一个版本的程序包：

PM> Install-Package YourPackageName -Version YourVersionNumber 
//Example
PM> Install-Package Microsoft.Extensions.FileProviders.Physical -Version 2.1.0

虽然答案和所讨论的包并没有直接关系，而且早在很久以前就有人问过它，但它是一种通用的，仍然相关，希望它能帮助一些人。

如果尝试使用反射进行后期绑定，如果绑定到的程序集具有强名称或其公钥标记已更改，则会引发完全相同的错误。即使实际上没有使用指定的公钥令牌找到任何程序集，错误也是一样的。

您需要添加正确的公钥令牌（可以使用dll上的sn-T获取它）以解决错误。希望这有帮助。

好的，再来一个答案。我之前将我的应用程序创建为64位，并相应地更改了输出路径（项目/财产/构建/输出/输出路径）。最近，我将应用程序更改为32位（x86），创建了一个新的输出路径。我创建了一个快捷方式，指向我认为编译的.exe要去的地方。无论我对源代码做了什么更改，它都得到了清单不匹配的错误。在大约一个小时的沮丧之后，我碰巧检查了.exe文件的日期/时间，发现它很旧，显然引用了旧的.dll。我正在将应用程序编译到旧目录中，我的快捷方式引用了新的。已将输出路径更改为.exe应指向的位置，运行快捷方式，错误消失。（拍打前额）