这可能是一个微不足道的问题,但我如何在python中并行化下面的循环?

# setup output lists
output1 = list()
output2 = list()
output3 = list()

for j in range(0, 10):
    # calc individual parameter value
    parameter = j * offset
    # call the calculation
    out1, out2, out3 = calc_stuff(parameter = parameter)

    # put results into correct output list
    output1.append(out1)
    output2.append(out2)
    output3.append(out3)

我知道如何在Python中启动单个线程,但我不知道如何“收集”结果。

多个进程也可以——在这种情况下,只要是最简单的就行。我目前使用的是Linux,但代码应该在Windows和Mac上运行。

并行化这段代码最简单的方法是什么?


当前回答

使用Ray有很多优点:

除了多个核(使用相同的代码)之外,还可以在多台机器上并行。 通过共享内存(和零拷贝序列化)有效地处理数值数据。 具有分布式调度的高任务吞吐量。 容错。

在本例中,您可以启动Ray并定义一个远程函数

import ray

ray.init()

@ray.remote(num_return_vals=3)
def calc_stuff(parameter=None):
    # Do something.
    return 1, 2, 3

然后并行地调用它

output1, output2, output3 = [], [], []

# Launch the tasks.
for j in range(10):
    id1, id2, id3 = calc_stuff.remote(parameter=j)
    output1.append(id1)
    output2.append(id2)
    output3.append(id3)

# Block until the results have finished and get the results.
output1 = ray.get(output1)
output2 = ray.get(output2)
output3 = ray.get(output3)

要在集群上运行相同的示例,唯一需要更改的行是对ray.init()的调用。相关文档可以在这里找到。

请注意,我正在帮助开发雷。

其他回答

并行处理的一个非常简单的例子是

from multiprocessing import Process

output1 = list()
output2 = list()
output3 = list()

def yourfunction():
    for j in range(0, 10):
        # calc individual parameter value
        parameter = j * offset
        # call the calculation
        out1, out2, out3 = calc_stuff(parameter=parameter)

        # put results into correct output list
        output1.append(out1)
        output2.append(out2)
        output3.append(out3)

if __name__ == '__main__':
    p = Process(target=pa.yourfunction, args=('bob',))
    p.start()
    p.join()

由于全局解释器锁(GIL)的存在,在CPython上使用多线程并不能为纯python代码提供更好的性能。我建议使用multiprocessing模块:

pool = multiprocessing.Pool(4)
out1, out2, out3 = zip(*pool.map(calc_stuff, range(0, 10 * offset, offset)))

注意,这在交互式解释器中不起作用。

为了避免GIL周围常见的FUD:在本例中使用线程没有任何优势。这里要使用进程,而不是线程,因为它们避免了一大堆问题。

为了并行化一个简单的for循环,joblib为多处理的原始使用带来了很多价值。不仅是简短的语法,还包括在迭代非常快的时候(以消除开销)进行透明的迭代聚集,或者捕获子进程的回溯,以获得更好的错误报告。

免责声明:我是joblib的原作者。

为什么不用线程和一个互斥来保护一个全局列表呢?

import os
import re
import time
import sys
import thread

from threading import Thread

class thread_it(Thread):
    def __init__ (self,param):
        Thread.__init__(self)
        self.param = param
    def run(self):
        mutex.acquire()
        output.append(calc_stuff(self.param))
        mutex.release()   


threads = []
output = []
mutex = thread.allocate_lock()

for j in range(0, 10):
    current = thread_it(j * offset)
    threads.append(current)
    current.start()

for t in threads:
    t.join()

#here you have output list filled with data

请记住,您的速度将与最慢的线程一样快

使用Ray有很多优点:

除了多个核(使用相同的代码)之外,还可以在多台机器上并行。 通过共享内存(和零拷贝序列化)有效地处理数值数据。 具有分布式调度的高任务吞吐量。 容错。

在本例中,您可以启动Ray并定义一个远程函数

import ray

ray.init()

@ray.remote(num_return_vals=3)
def calc_stuff(parameter=None):
    # Do something.
    return 1, 2, 3

然后并行地调用它

output1, output2, output3 = [], [], []

# Launch the tasks.
for j in range(10):
    id1, id2, id3 = calc_stuff.remote(parameter=j)
    output1.append(id1)
    output2.append(id2)
    output3.append(id3)

# Block until the results have finished and get the results.
output1 = ray.get(output1)
output2 = ray.get(output2)
output3 = ray.get(output3)

要在集群上运行相同的示例,唯一需要更改的行是对ray.init()的调用。相关文档可以在这里找到。

请注意,我正在帮助开发雷。