似乎没有函数可以简单地计算numpy/scipy的移动平均值,这导致了复杂的解决方案。

我的问题有两个方面:

用numpy(正确地)实现移动平均的最简单方法是什么? 既然这似乎不是小事,而且容易出错,有没有一个很好的理由不包括电池在这种情况下?


当前回答

我要么使用公认答案的解决方案,稍微修改以使输出和输入的长度相同,要么使用另一个答案的评论中提到的熊猫版本。我在这里用一个可重复的例子来总结两者,以供将来参考:

import numpy as np
import pandas as pd

def moving_average(a, n):
    ret = np.cumsum(a, dtype=float)
    ret[n:] = ret[n:] - ret[:-n]
    return ret / n

def moving_average_centered(a, n):
    return pd.Series(a).rolling(window=n, center=True).mean().to_numpy()

A = [0, 0, 1, 2, 4, 5, 4]
print(moving_average(A, 3))    
# [0.         0.         0.33333333 1.         2.33333333 3.66666667 4.33333333]
print(moving_average_centered(A, 3))
# [nan        0.33333333 1.         2.33333333 3.66666667 4.33333333 nan       ]

其他回答

移动平均线 迭代器方法 在i处反转数组,简单地求i到n的均值。 使用列表推导式在运行中生成迷你数组。

x = np.random.randint(10, size=20)

def moving_average(arr, n):
    return [ (arr[:i+1][::-1][:n]).mean() for i, ele in enumerate(arr) ]
d = 5

moving_average(x, d)

张量卷积

moving_average = np.convolve(x, np.ones(d)/d, mode='valid')

我觉得使用瓶颈可以很容易地解决这个问题

参见下面的基本示例:

import numpy as np
import bottleneck as bn

a = np.random.randint(4, 1000, size=(5, 7))
mm = bn.move_mean(a, window=2, min_count=1)

这就给出了每个轴上的移动平均值。

“mm”是“a”的移动平均值。 “窗口”是考虑移动均值的最大条目数。 "min_count"是考虑移动平均值的最小条目数(例如,对于第一个元素或如果数组有nan值)。

好在瓶颈有助于处理nan值,而且非常高效。

NumPy缺乏特定领域的函数可能是由于核心团队的纪律和对NumPy主要指令的忠实:提供n维数组类型,以及用于创建和索引这些数组的函数。像许多基本目标一样,这个目标并不小,NumPy出色地完成了它。

更大的SciPy包含更大的特定于领域的库集合(被SciPy开发人员称为子包)——例如,数值优化(optimize)、信号处理(signal)和积分(integrate)。

我的猜测是,您要查找的函数至少在SciPy子包中的一个(SciPy。也许信号);然而,我将首先在SciPy scikit集合中查找,确定相关的scikit并在其中寻找感兴趣的函数。

Scikits是基于NumPy/SciPy独立开发的包,并针对特定的技术规程(例如,Scikits -image, Scikits -learn等),其中几个(特别是用于数值优化的令人钦佩的OpenOpt)在选择位于相对较新的Scikits主题之下很久以前就得到了高度重视,成熟的项目。Scikits主页上列出了大约30个这样的Scikits,尽管其中至少有几个已经不再处于积极的开发中。

按照这个建议,你会发现scikits-timeseries;但是,该软件包已不再处于积极开发阶段;实际上,Pandas已经成为AFAIK,事实上的基于numpy的时间序列库。

Pandas有几个函数可以用来计算移动平均线;其中最简单的可能是rolling_mean,你可以这样使用:

>>> # the recommended syntax to import pandas
>>> import pandas as PD
>>> import numpy as NP

>>> # prepare some fake data:
>>> # the date-time indices:
>>> t = PD.date_range('1/1/2010', '12/31/2012', freq='D')

>>> # the data:
>>> x = NP.arange(0, t.shape[0])

>>> # combine the data & index into a Pandas 'Series' object
>>> D = PD.Series(x, t)

现在,只需调用函数rolling_mean,传入Series对象和窗口大小,在下面的例子中是10天。

>>> d_mva = PD.rolling_mean(D, 10)

>>> # d_mva is the same size as the original Series
>>> d_mva.shape
    (1096,)

>>> # though obviously the first w values are NaN where w is the window size
>>> d_mva[:3]
    2010-01-01         NaN
    2010-01-02         NaN
    2010-01-03         NaN

验证它是否有效。,将原系列中的值10 - 15与用滚动平均值平滑的新系列进行比较

>>> D[10:15]
     2010-01-11    2.041076
     2010-01-12    2.041076
     2010-01-13    2.720585
     2010-01-14    2.720585
     2010-01-15    3.656987
     Freq: D

>>> d_mva[10:20]
      2010-01-11    3.131125
      2010-01-12    3.035232
      2010-01-13    2.923144
      2010-01-14    2.811055
      2010-01-15    2.785824
      Freq: D

The function rolling_mean, along with about a dozen or so other function are informally grouped in the Pandas documentation under the rubric moving window functions; a second, related group of functions in Pandas is referred to as exponentially-weighted functions (e.g., ewma, which calculates exponentially moving weighted average). The fact that this second group is not included in the first (moving window functions) is perhaps because the exponentially-weighted transforms don't rely on a fixed-length window

如果你想仔细考虑边缘条件(只从边缘的可用元素计算平均值),下面的函数可以解决这个问题。

import numpy as np

def running_mean(x, N):
    out = np.zeros_like(x, dtype=np.float64)
    dim_len = x.shape[0]
    for i in range(dim_len):
        if N%2 == 0:
            a, b = i - (N-1)//2, i + (N-1)//2 + 2
        else:
            a, b = i - (N-1)//2, i + (N-1)//2 + 1

        #cap indices to min and max indices
        a = max(0, a)
        b = min(dim_len, b)
        out[i] = np.mean(x[a:b])
    return out

>>> running_mean(np.array([1,2,3,4]), 2)
array([1.5, 2.5, 3.5, 4. ])

>>> running_mean(np.array([1,2,3,4]), 3)
array([1.5, 2. , 3. , 3.5])

从Numpy 1.20开始,sliding_window_view提供了一种在元素窗口中滑动/滚动的方法。然后你可以分别取平均值。

例如,对于一个4元素的窗口:

from numpy.lib.stride_tricks import sliding_window_view

# values = np.array([5, 3, 8, 10, 2, 1, 5, 1, 0, 2])
np.average(sliding_window_view(values, window_shape = 4), axis=1)
# array([6.5, 5.75, 5.25, 4.5, 2.25, 1.75, 2])

注意sliding_window_view的中间结果:

# values = np.array([5, 3, 8, 10, 2, 1, 5, 1, 0, 2])
sliding_window_view(values, window_shape = 4)
# array([[ 5,  3,  8, 10],
#        [ 3,  8, 10,  2],
#        [ 8, 10,  2,  1],
#        [10,  2,  1,  5],
#        [ 2,  1,  5,  1],
#        [ 1,  5,  1,  0],
#        [ 5,  1,  0,  2]])