我有一个Numpy数组类型的矩阵。我怎么把它作为映像写到磁盘上呢?任何格式都可以(png, jpeg, bmp…)一个重要的限制是PIL不存在。


当前回答

如果你碰巧已经在使用[Py]Qt,你可能会对qimage2ndarray感兴趣。从版本1.4(刚刚发布)开始,PySide也得到了支持,并且将有一个类似于scipy的微小imsave(文件名,数组)函数,但使用Qt而不是PIL。在1.3版本中,只需使用如下代码:

qImage = array2qimage(image, normalize = False) # create QImage from ndarray
success = qImage.save(filename) # use Qt's image IO functions for saving PNG/JPG/..

(1.4的另一个优点是它是一个纯python解决方案,这使得它更加轻量级。)

其他回答

下面的答案中有@Nima Farhadi在时间测量方面提出的方法。

最快的是CV2,但重要的是要改变颜色顺序从RGB到BGR。简单的是matplotlib。

重要的是要确保数组有unsigned integer format uint8/16/32。

代码:

#Matplotlib
from matplotlib import pyplot as plt
plt.imsave('c_plt.png', c.astype(np.uint8))

#PIL
from PIL import Image
image = Image.fromarray(c.astype(np.uint8))
image.save('c_pil.png')


#CV2, OpenCV
import cv2
cv2.imwrite('c_cv2.png', cv2.cvtColor(c, cv2.COLOR_RGB2BGR))

这个世界可能不需要另一个包来将numpy数组写入PNG文件,但对于那些无法满足的人,我最近在github上发布了numpngw:

https://github.com/WarrenWeckesser/numpngw

在pypi上:https://pypi.python.org/pypi/numpngw/

唯一的外部依赖项是numpy。

下面是存储库的examples目录中的第一个示例。基本路线很简单

write_png('example1.png', img)

其中img是一个numpy数组。该行之前的所有代码都是导入语句和创建img的代码。

import numpy as np
from numpngw import write_png


# Example 1
#
# Create an 8-bit RGB image.

img = np.zeros((80, 128, 3), dtype=np.uint8)

grad = np.linspace(0, 255, img.shape[1])

img[:16, :, :] = 127
img[16:32, :, 0] = grad
img[32:48, :, 1] = grad[::-1]
img[48:64, :, 2] = grad
img[64:, :, :] = 127

write_png('example1.png', img)

下面是它创建的PNG文件:

另外,我使用了numpngw。write_apng在Voronoi图表中创建动画。

我附加了一个简单的例程来将npy转换为图像。

from PIL import Image
import matplotlib

img = np.load('flair1_slice75.npy')

matplotlib.image.imsave("G1_flair_75.jpeg", img)

这使用PIL,但是有些人可能会发现它很有用:

import scipy.misc
scipy.misc.imsave('outfile.jpg', image_array)

编辑:当前scipy版本开始规范化所有图像,使min(数据)变成黑色,max(数据)变成白色。如果数据应该是精确的灰色级别或精确的RGB通道,这是不需要的。解决方案:

import scipy.misc
scipy.misc.toimage(image_array, cmin=0.0, cmax=...).save('outfile.jpg')

Matplotlib SVN有一个新函数,可以将图像保存为图像-没有轴等,这是一个非常简单的函数,如果你不想安装SVN(直接从Matplotlib SVN中的image.py复制,为了简洁,删除了文档字符串):

def imsave(fname, arr, vmin=None, vmax=None, cmap=None, format=None, origin=None):
    from matplotlib.backends.backend_agg import FigureCanvasAgg as FigureCanvas
    from matplotlib.figure import Figure

    fig = Figure(figsize=arr.shape[::-1], dpi=1, frameon=False)
    canvas = FigureCanvas(fig)
    fig.figimage(arr, cmap=cmap, vmin=vmin, vmax=vmax, origin=origin)
    fig.savefig(fname, dpi=1, format=format)