我有同样的问题，在gradle创建一个胖罐;更新构建。Gradle文件排除行纠正了这个问题。

jar {
    from {
        configurations.compile.collect {
            it.isDirectory() ? it : zipTree(it)
        }
    }
    exclude 'META-INF/*.RSA', 'META-INF/*.SF','META-INF/*.DSA'
    manifest {
        attributes 'Main-Class': 'com.test.Main'
    }
}

Error: A JNI error has occurred, please check your installation and try again Exception in thread "main" java.lang.SecurityException: Invalid signature file digest for Manifest main attributes at sun.security.util.SignatureFileVerifier.processImpl(SignatureFileVerifier.java:314) at sun.security.util.SignatureFileVerifier.process(SignatureFileVerifier.java:268) at java.util.jar.JarVerifier.processEntry(JarVerifier.java:316) at java.util.jar.JarVerifier.update(JarVerifier.java:228) at java.util.jar.JarFile.initializeVerifier(JarFile.java:383) at java.util.jar.JarFile.getInputStream(JarFile.java:450) at sun.misc.URLClassPath$JarLoader$2.getInputStream(URLClassPath.java:977) at sun.misc.Resource.cachedInputStream(Resource.java:77) at sun.misc.Resource.getByteBuffer(Resource.java:160) at java.net.URLClassLoader.defineClass(URLClassLoader.java:454) at java.net.URLClassLoader.access$100(URLClassLoader.java:73) at java.net.URLClassLoader$1.run(URLClassLoader.java:368) at java.net.URLClassLoader$1.run(URLClassLoader.java:362) at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method) at java.net.URLClassLoader.findClass(URLClassLoader.java:361) at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:424) at sun.misc.Launcher$AppClassLoader.loadClass(Launcher.java:331) at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:357) at sun.launcher.LauncherHelper.checkAndLoadMain(LauncherHelper.java:495)

帮助我的(IntelliJ IDEA 2016.3): 文件->项目结构-> Artifacts ->添加JAR ->选择主类->选择“通过manifest复制到输出目录和链接”->确定->应用->构建->构建Artifacts…- >构建

这里列出的解决方案可能提供一个指针。

清单主属性的签名文件摘要无效

底线:

最好把官方的罐子保存为 只是将其作为依赖项添加到您的manifest文件中 应用程序jar文件。

比较新jar和旧jar中的META-INF文件夹(在添加新库之前)。有可能会有新的文件。如果是，可以删除。这应该会有所帮助。 问候, 999米甲

我也遇到过同样的问题，经过参考，它的工作原理如下:

<plugin>
    <groupId>org.apache.maven.plugins</groupId>
    <artifactId>maven-shade-plugin</artifactId>
    <version>3.2.1</version>
    <configuration>
        <createDependencyReducedPom>false</createDependencyReducedPom>
    </configuration>
    <executions>
        <execution>
            <phase>package</phase>
            <goals>
                <goal>shade</goal>
            </goals>
            <configuration>
                <filters>
                    <filter>
                        <artifact>*:*</artifact>
                        <excludes>
                            <exclude>META-INF/*.SF</exclude>
                            <exclude>META-INF/*.DSA</exclude>
                            <exclude>META-INF/*.RSA</exclude>
                        </excludes>
                    </filter>
                </filters>
            </configuration>
        </execution>
    </executions>
</plugin>

如果您在尝试为Xamarin绑定JAR文件时遇到这种情况。Android绑定项目如下:

J2XA006:在反映清单主属性的com.your.class:无效签名文件摘要时引发了缺少类错误

只需使用Winzip打开JAR文件并删除meta-inf目录。重建-工作完成