我在使用IntelliJ IDEA 14.01时遇到了这个问题。

我可以通过以下方法修复它:

文件->项目结构->添加新的(工件)->jar->从模块与依赖创建jar从模块窗口:

选择你的主要类

来自库的JAR文件 选择复制到输出目录和链接通过清单

对于使用kotlin脚本(kts)作为构建脚本的人:

task("fatJar", type = Jar::class) {
baseName = "${project.name}-fat"
manifest {
    attributes["Implementation-Title"] = "Watcher Jar File"
    attributes["Implementation-Version"] = version
    attributes["Main-Class"] = "MainKt"
}
from(configurations.runtimeClasspath.get().map { if (it.isDirectory) it else zipTree(it) }) {
    exclude(listOf("META-INF/*.RSA", "META-INF/*.SF", "META-INF/*.DSA"))
}
with(tasks.jar.get() as CopySpec)

}

这发生在我在Intellij中，当我点击“添加为Maven项目”底线时，Intellij说“发现非托管pom文件”。同时，out文件夹已经生成。所以它最近没有变化。

删除文件夹和运行程序解决了我的问题。然后重新创建Out文件夹。

看看小狐狸的回答吧。我收到的错误和他的非常相似。

假设您使用ant构建jar文件，您可以指示ant去掉META-INF目录。这是我的蚂蚁目标的简化版本:

<jar destfile="app.jar" basedir="${classes.dir}">
    <zipfileset excludes="META-INF/**/*" src="${lib.dir}/bcprov-jdk16-145.jar"></zipfileset>
    <manifest>
        <attribute name="Main-Class" value="app.Main"/>
    </manifest>
</jar>

对于那些在尝试使用maven-shade-plugin创建阴影超级jar时遇到此错误的人，解决方案是通过在插件配置中添加以下行来排除清单签名文件:

<configuration>
    <filters>
        <filter>
            <artifact>*:*</artifact>
            <excludes>
                <exclude>META-INF/*.SF</exclude>
                <exclude>META-INF/*.DSA</exclude>
                <exclude>META-INF/*.RSA</exclude>
            </excludes>
        </filter>
    </filters>
    <!-- Additional configuration. -->
</configuration>

如果您正在寻找一个不解包或修改原始库，而是使用一个特殊的JAR类加载器的Fat JAR解决方案，请参阅我这里的项目。

免责声明:代码不是我写的，只是打包并发布在Maven Central上，并在我的阅读中描述如何使用它。

我个人使用它来创建包含BouncyCastle依赖的可运行的优jar。也许它对你也有用。