我想使用Python将打印重定向到一个.txt文件。我有一个for循环，它将打印每个.bam文件的输出，而我想将所有输出重定向到一个文件。所以我试着说:
f = open('output.txt','w')
sys.stdout = f
在我剧本的开头。但是，我在.txt文件中什么也没有得到。
我的剧本是:
#!/usr/bin/python
import os,sys
import subprocess
import glob
from os import path
f = open('output.txt','w')
sys.stdout = f
path= '/home/xxx/nearline/bamfiles'
bamfiles = glob.glob(path + '/*.bam')
for bamfile in bamfiles:
filename = bamfile.split('/')[-1]
print 'Filename:', filename
samtoolsin = subprocess.Popen(["/share/bin/samtools/samtools","view",bamfile],
stdout=subprocess.PIPE,bufsize=1)
linelist= samtoolsin.stdout.readlines()
print 'Readlines finished!'
那么问题是什么呢?除了sys。stdout还有其他方法吗?
我需要我的结果看起来像:
Filename: ERR001268.bam
Readlines finished!
Mean: 233
SD: 10
Interval is: (213, 252)
不要使用打印，使用日志记录
您可以更改sys。Stdout指向文件，但这是一种相当笨拙且不灵活的处理此问题的方法。不要使用print，而是使用logging模块。
使用日志记录，您可以像打印stdout一样进行打印，也可以将输出写入文件。您甚至可以使用不同的消息级别(关键、错误、警告、信息、调试)，例如，只将主要问题打印到控制台，但仍然将次要代码操作记录到文件中。
一个简单的例子
导入日志记录，获取日志记录器，并设置处理级别:
import logging
logger = logging.getLogger()
logger.setLevel(logging.DEBUG) # process everything, even if everything isn't printed
如果你想打印到标准输出:
ch = logging.StreamHandler()
ch.setLevel(logging.INFO) # or any other level
logger.addHandler(ch)
如果你也想写入一个文件(如果你只想写入一个文件，跳过最后一部分):
fh = logging.FileHandler('myLog.log')
fh.setLevel(logging.DEBUG) # or any level you want
logger.addHandler(fh)
然后，无论你在哪里使用打印，请使用记录器方法之一:
# print(foo)
logger.debug(foo)
# print('finishing processing')
logger.info('finishing processing')
# print('Something may be wrong')
logger.warning('Something may be wrong')
# print('Something is going really bad')
logger.error('Something is going really bad')
要了解关于使用更高级日志功能的更多信息，请阅读Python文档中的优秀日志教程。
如果重定向stdout对您的问题有效，Gringo Suave的回答很好地演示了如何进行重定向。
为了让它更简单，我使用上下文管理器创建了一个版本，使用with语句实现了简洁的通用调用语法:
from contextlib import contextmanager
import sys
@contextmanager
def redirected_stdout(outstream):
orig_stdout = sys.stdout
try:
sys.stdout = outstream
yield
finally:
sys.stdout = orig_stdout
要使用它，你只需要执行以下操作(源自Suave的例子):
with open('out.txt', 'w') as outfile:
with redirected_stdout(outfile):
for i in range(2):
print('i =', i)
当模块以您不喜欢的方式使用它时，它对于选择性地重定向打印非常有用。唯一的缺点(在许多情况下这是解决问题的关键)是，如果想要多个具有不同stdout值的线程，它就不起作用，但这需要一种更好、更通用的方法:间接模块访问。你可以在这个问题的其他答案中看到它的实现。
这是我用来打印到文件/日志的另一种方法…修改内置的打印函数，使其记录到具有当前时间戳的temp目录中的文件，并打印到stdout。在脚本中这样做的唯一真正好处是不需要去修改现有的打印语句。
print('test')
test
复制原始打印函数到新变量
og_print = print
og_print('test2')
test2
覆盖现有的打印功能
def print(*msg):
'''print and log!'''
# import datetime for timestamps
import datetime as dt
# convert input arguments to strings for concatenation
message = []
for m in msg:
message.append(str(m))
message = ' '.join(message)
# append to the log file
with open('/tmp/test.log','a') as log:
log.write(f'{dt.datetime.now()} | {message}\n')
# print the message using the copy of the original print function to stdout
og_print(message)
print('test3')
test3
显示文件
cat /tmp/test.log
2022-01-25 10:19:11.045062 | test3
删除文件
rm /tmp/test.log
不要使用打印，使用日志记录
您可以更改sys。Stdout指向文件，但这是一种相当笨拙且不灵活的处理此问题的方法。不要使用print，而是使用logging模块。
使用日志记录，您可以像打印stdout一样进行打印，也可以将输出写入文件。您甚至可以使用不同的消息级别(关键、错误、警告、信息、调试)，例如，只将主要问题打印到控制台，但仍然将次要代码操作记录到文件中。
一个简单的例子
导入日志记录，获取日志记录器，并设置处理级别:
import logging
logger = logging.getLogger()
logger.setLevel(logging.DEBUG) # process everything, even if everything isn't printed
如果你想打印到标准输出:
ch = logging.StreamHandler()
ch.setLevel(logging.INFO) # or any other level
logger.addHandler(ch)
如果你也想写入一个文件(如果你只想写入一个文件，跳过最后一部分):
fh = logging.FileHandler('myLog.log')
fh.setLevel(logging.DEBUG) # or any level you want
logger.addHandler(fh)
然后，无论你在哪里使用打印，请使用记录器方法之一:
# print(foo)
logger.debug(foo)
# print('finishing processing')
logger.info('finishing processing')
# print('Something may be wrong')
logger.warning('Something may be wrong')
# print('Something is going really bad')
logger.error('Something is going really bad')
要了解关于使用更高级日志功能的更多信息，请阅读Python文档中的优秀日志教程。
