如何重定向'打印'输出到一个文件?

我想使用Python将打印重定向到一个.txt文件。我有一个for循环，它将打印每个.bam文件的输出，而我想将所有输出重定向到一个文件。所以我试着说:

f = open('output.txt','w')
sys.stdout = f

在我剧本的开头。但是，我在.txt文件中什么也没有得到。我的剧本是:

#!/usr/bin/python

import os,sys
import subprocess
import glob
from os import path

f = open('output.txt','w')
sys.stdout = f

path= '/home/xxx/nearline/bamfiles'
bamfiles = glob.glob(path + '/*.bam')

for bamfile in bamfiles:
    filename = bamfile.split('/')[-1]
    print 'Filename:', filename
    samtoolsin = subprocess.Popen(["/share/bin/samtools/samtools","view",bamfile],
                                  stdout=subprocess.PIPE,bufsize=1)
    linelist= samtoolsin.stdout.readlines()
    print 'Readlines finished!'

那么问题是什么呢?除了sys。stdout还有其他方法吗?

我需要我的结果看起来像:

Filename: ERR001268.bam
Readlines finished!
Mean: 233
SD: 10
Interval is: (213, 252)

当前回答

它扩展了循环的打印函数

x = 0
while x <=5:
    x = x + 1
    with open('outputEis.txt', 'a') as f:
        print(x, file=f)
    f.close()

2017-07-16 19:34:04

其他回答

如果您正在使用Linux，我建议您使用tee命令。实现如下所示:

python python_file.py | tee any_file_name.txt

如果您不想更改代码中的任何内容，我认为这可能是最好的解决方案。您也可以实现记录器，但您需要在代码中做一些更改。

2018-01-23 15:51:35

Python 2或Python 3 API参考:

Print (*objects, sep=' '， end='\n'， file=sys. txt)stdout,冲洗= False) file参数必须是一个具有write(string)方法的对象;如果不存在或为None，则sys。将使用Stdout。由于打印参数被转换为文本字符串，print()不能用于二进制模式的文件对象。对于这些，使用file.write(…)代替。

由于文件对象通常包含write()方法，您所需要做的就是将一个文件对象传递到它的参数中。

写入/覆盖到文件

with open('file.txt', 'w') as f:
    print('hello world', file=f)

写入/追加到文件

with open('file.txt', 'a') as f:
    print('hello world', file=f)

2016-07-04 13:45:25

如果重定向stdout对您的问题有效，Gringo Suave的回答很好地演示了如何进行重定向。

为了让它更简单，我使用上下文管理器创建了一个版本，使用with语句实现了简洁的通用调用语法:

from contextlib import contextmanager
import sys

@contextmanager
def redirected_stdout(outstream):
    orig_stdout = sys.stdout
    try:
        sys.stdout = outstream
        yield
    finally:
        sys.stdout = orig_stdout

要使用它，你只需要执行以下操作(源自Suave的例子):

with open('out.txt', 'w') as outfile:
    with redirected_stdout(outfile):
        for i in range(2):
            print('i =', i)

当模块以您不喜欢的方式使用它时，它对于选择性地重定向打印非常有用。唯一的缺点(在许多情况下这是解决问题的关键)是，如果想要多个具有不同stdout值的线程，它就不起作用，但这需要一种更好、更通用的方法:间接模块访问。你可以在这个问题的其他答案中看到它的实现。

2019-01-06 04:48:39

它扩展了循环的打印函数

x = 0
while x <=5:
    x = x + 1
    with open('outputEis.txt', 'a') as f:
        print(x, file=f)
    f.close()

2017-07-16 19:34:04

这是我用来打印到文件/日志的另一种方法…修改内置的打印函数，使其记录到具有当前时间戳的temp目录中的文件，并打印到stdout。在脚本中这样做的唯一真正好处是不需要去修改现有的打印语句。

print('test')

test

复制原始打印函数到新变量

og_print = print
og_print('test2')

test2

覆盖现有的打印功能

def print(*msg):
    '''print and log!'''
    # import datetime for timestamps
    import datetime as dt
    # convert input arguments to strings for concatenation
    message = []
    for m in msg:
        message.append(str(m))
    message = ' '.join(message)
    # append to the log file
    with open('/tmp/test.log','a') as log:
        log.write(f'{dt.datetime.now()} | {message}\n')
    # print the message using the copy of the original print function to stdout
    og_print(message)

print('test3')

test3

显示文件

cat /tmp/test.log

2022-01-25 10:19:11.045062 | test3

删除文件

rm /tmp/test.log

2022-01-25 15:28:58

如何重定向'打印'输出到一个文件?

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