GitHub Pages(基本上是Jekyll的包装器)似乎使用了kramdown，它实现了所有Maruku，因此通过atoc属性支持自动生成的目录:

* auto-gen TOC:
{:toc}

第一行只是开始一个无序列表，实际上被丢弃了。

这将使用文档中的头文件生成一组嵌套的无序列表。

注意:这应该适用于GitHub页面，而不是评论或wiki页面中使用的GitHub调味Markdown (GFM)。我想这个问题没有解决办法。

更新2022 - 02年

在VSCode中，检查扩展“Markdown All In One”。自动生成并更新减记的TOC。

安装扩展。 将光标放在您想要插入TOC的位置。 运行命令“Markdown All in One:创建目录” 享受吧!

大多数其他答案需要安装一些工具。 我找到了一个快速简单的在线解决方案https://imthenachoman.github.io/nGitHubTOC。

对于任何markdown输入，它生成内容输出表。 您可以指定最小和最大标题级别。

源代码位于https://github.com/imthenachoman/nGitHubTOC

在使用Visual Studio Code时，实现mardown文件目录的一个非常方便的方法是扩展名Markdown-TOC。

它可以向现有的markdown文件添加toc，甚至在保存时保持toc的最新状态。

可以从README中使用http://documentup.com/自动生成一个网页。md文件。它不是创建TOC，但对于许多人来说，它可能解决了想要创建TOC的原因。

Documentup的另一个替代方案是Flatdoc: http://ricostacruz.com/flatdoc/

无耻的“借用”这个SO答案。

你可以用Pandoc做到这一点。

pandoc -s --toc input.md -o input_toc.md 

注意:输入和输出文件的顺序在这里很重要。