我有一个类似于下面的目录结构

meta_project
    project1
        __init__.py
        lib
            module.py
            __init__.py
    notebook_folder
        notebook.jpynb

当在notebook.jpynb中工作时,如果我尝试使用相对导入来访问module.py中的函数function():

from ..project1.lib.module import function

我得到以下错误:

SystemError                               Traceback (most recent call last)
<ipython-input-7-6393744d93ab> in <module>()
----> 1 from ..project1.lib.module import function

SystemError: Parent module '' not loaded, cannot perform relative import

有什么方法可以使用相对导入让它工作吗?

注意,笔记本服务器是在meta_project目录级别上实例化的,因此它应该能够访问这些文件中的信息。

还要注意,至少在最初的计划中,project1并没有被认为是一个模块,因此没有__init__.py文件,它只是作为一个文件系统目录。如果问题的解决方案需要将其视为一个模块,并包含__init__.py文件(甚至是一个空白文件),这是可以的,但这样做还不足以解决问题。

我在机器之间共享这个目录,相对导入允许我在任何地方使用相同的代码,而且我经常使用笔记本电脑进行快速原型设计,所以涉及拼接绝对路径的建议不太可能有帮助。


编辑:这与Python 3中的相对导入不同,后者一般讨论Python 3中的相对导入,特别是从包目录中运行脚本。这与在jupyter笔记本中尝试调用另一个目录中的本地模块中的函数有关,该目录具有不同的一般和特定方面。


当前回答

来这里寻找在notebook中工作时将代码抽象为子模块的最佳实践。我不确定是否有最佳做法。我一直在提议这个。

项目层次结构如下:

├── ipynb
│   ├── 20170609-Examine_Database_Requirements.ipynb
│   └── 20170609-Initial_Database_Connection.ipynb
└── lib
    ├── __init__.py
    └── postgres.py

从20170609-Initial_Database_Connection.ipynb:

    In [1]: cd ..

    In [2]: from lib.postgres import database_connection

这是因为默认情况下Jupyter Notebook可以解析cd命令。注意,这并没有使用Python Notebook魔法。它只是工作,没有预先%bash。

考虑到我在100次中有99次使用Project Jupyter Docker图像在Docker中工作,下面的修改是幂等的

    In [1]: cd /home/jovyan

    In [2]: from lib.postgres import database_connection

其他回答

改进@joshua-cook使用cd的答案。,为了确保你没有重新运行单元格,并在使用run all without restart时搞乱你的目录,请使用以下代码:

if 'NOTEBOOK_INITIATED_FLAG' not in globals():
    NOTEBOOK_INITIATED_FLAG = True
    %cd ..
%pwd

NOTEBOOK_INITIATED_FLAG用作占位符,标记内核已经在运行,因此不需要更改目录。

这是一个超级复杂的样板文件,如果你想使用jupytext并从父文件夹运行你的.py文件:

import os
import sys

if 'NOTEBOOK_INITIATED_FLAG' not in globals():
    NOTEBOOK_INITIATED_FLAG = True
    
    try:
        # not in notebook
        module_path = os.path.join(os.path.dirname(__file__), os.pardir)
    except:
        # in notebook
        module_path = os.path.abspath(os.path.join('..'))
        %cd ..
        %pwd

    if module_path not in sys.path:
        sys.path.append(module_path)

对于那些不像我一样理解解决方案的人,您必须根据您的特定问题深入到所需的目录中。此错误的解决方案:

没有名为your_folder的模块

我工作用的笔记本在:

C: \ Users \ vojte威廉姆斯喝predicta EDA喝公寓\ EDA.ipynb。

我想导入这个笔记本:

C:\Users\vojte\projects\functions\ functions.ipynb

我不得不通过@metakermit修改上面的解决方案为这个解决方案:

import os
import sys
module_path = os.path.abspath(os.path.join('..\..\..'))
if module_path not in sys.path:
    sys.path.append(module_path)

from functions import functions as f

您可以检查sys。附加目录的路径。在这个例子中,这一行被追加了:

C: \ \ \ \用户vojte \ \项目

如果你在VS Code中通过Jupyter扩展工作,我发现你现在可以在你的设置中设置这个路径。json文件。

{
    "jupyter.notebookFileRoot": "/path/to/your/module/root"
}

编辑:或者,更一般地将其设置在工作区根目录下:

{
    "jupyter.notebookFileRoot": "${workspaceFolder}"
}

我很生气,所以我写了一个包裹。

pip install package_root,然后你可以将package_root #导入你的PYTHONPATH。

这是通过查看调用堆栈来确定哪个文件导入了package_root,然后遍历目录以找到缺少__init__.py文件的第一个目录。

所以在实践中,你需要将__init__.py文件添加到你的笔记本目录中,就像让Python包工作一样。

我刚刚找到了一个漂亮的解决方案:

import sys; sys.path.insert(0, '..') # add parent folder path where lib folder is
import lib.store_load # store_load is a file on my library folder

你只需要文件的一些函数

from lib.store_load import your_function_name

如果python版本>= 3.3,则文件夹中不需要init.py文件