这里有一个使用递归的简单但完美的解决方案:

public static List<Path> listFiles(String rootDirectory)
{
    List<Path> files = new ArrayList<>();
    listFiles(rootDirectory, files);

    return files;
}

private static void listFiles(String path, List<Path> collectedFiles)
{
    File root = new File(path);
    File[] files = root.listFiles();

    if (files == null)
    {
        return;
    }

    for (File file : files)
    {
        if (file.isDirectory())
        {
            listFiles(file.getAbsolutePath(), collectedFiles);
        } else
        {
            collectedFiles.add(file.toPath());
        }
    }
}

具有单个列表的非递归BFS(特定的示例是搜索*。eml文件):

    final FileFilter filter = new FileFilter() {
        @Override
        public boolean accept(File file) {
            return file.isDirectory() || file.getName().endsWith(".eml");
        }
    };

    // BFS recursive search
    List<File> queue = new LinkedList<File>();
    queue.addAll(Arrays.asList(dir.listFiles(filter)));

    for (ListIterator<File> itr = queue.listIterator(); itr.hasNext();) {
        File file = itr.next();
        if (file.isDirectory()) {
            itr.remove();
            for (File f: file.listFiles(filter)) itr.add(f);
        }
    }

import java.io.File;

public class Main {
    public static void main(String[] args) {
        loopFiles(new File("C:\\Users\\serge.klimkovitch\\Documents"));
    }

    private static void loopFiles(File element) {
        if (element.isDirectory()) {
            for (File currentFile : element.listFiles()) {
                loopFiles(currentFile);
                System.out.println(currentFile);
            }
        }
    }
}

Java 8提供了一个很好的流来处理树中的所有文件。

try (Stream<Path> stream = Files.walk(Paths.get(path))) {
    stream.filter(Files::isRegularFile)
          .forEach(System.out::println);
}

这提供了一种自然的遍历文件的方法。因为它是一个流，你可以对结果做所有漂亮的流操作，如限制，分组，映射，退出等。

更新:我可能会指出还有文件。find使用一个BiPredicate，如果需要检查文件属性，这可能更有效。

Files.find(Paths.get(path),
           Integer.MAX_VALUE,
           (filePath, fileAttr) -> fileAttr.isRegularFile())
        .forEach(System.out::println);

注意，虽然JavaDoc回避了这个方法可能比Files更有效。Walk实际上是相同的，如果您也在过滤器中检索文件属性，则可以观察到性能上的差异。最后，如果需要筛选属性，请使用Files。find，否则使用Files。步行，主要是因为交通超载，而且更方便。

测试:根据要求，我提供了许多答案的性能比较。查看包含结果和测试用例的Github项目。

public static String getExten(String path) {
    int i = path.lastIndexOf('.');
    if (i > 0) {
       return path.substring(i);
    }
    else return "";
}
public static List<String> GetAllFiles(String path, List<String>fileList){
    File file = new File(path);
    
    File[] files = file.listFiles();
    for(File folder:files) {
        if(extensions.contains(getExten(folder.getPath()))) {
            fileList.add(folder.getPath());
        }
    }
    File[] direcs = file.listFiles(File::isDirectory);
    for(File dir:direcs) {
        GetAllFiles(dir.getPath(),fileList);
    }
    return fileList;
    
}

这是一个简单的递归函数，应该会提供所有文件。Extensions是一个字符串列表，它只包含那些被接受的扩展名。例如扩展名= [".txt"，".docx"]等。

我的建议是:

public void list(File file) {
    System.out.println(file.getName());
    File[] children = file.listFiles();
    for (File child : children) {
        list(child);
    }
}

System.out.println只是用来指示对该文件执行一些操作。没有必要区分文件和目录，因为一个正常的文件只会有零个子文件。