Java 7将有has Files.walkFileTree:

如果您提供了一个起点和一个文件访问器，当它在文件树中遍历文件时，它将调用文件访问器上的各种方法。我们希望人们在开发递归复制、递归移动、递归删除或在每个文件上设置权限或执行其他操作的递归操作时使用这种方法。

现在有一个关于这个问题的完整的Oracle教程。

这段代码可以运行了

public static void main(String... args) {
    File[] files = new File("D:/").listFiles();
    if (files != null) 
       getFiles(files);
}

public static void getFiles(File[] files) {
    for (File file : files) {
        if (file.isDirectory()) {
            getFiles(file.listFiles());
        } else {
            System.out.println("File: " + file);
        }
    }
}

我的建议是:

public void list(File file) {
    System.out.println(file.getName());
    File[] children = file.listFiles();
    for (File child : children) {
        list(child);
    }
}

System.out.println只是用来指示对该文件执行一些操作。没有必要区分文件和目录，因为一个正常的文件只会有零个子文件。

这里有一个使用递归的简单但完美的解决方案:

public static List<Path> listFiles(String rootDirectory)
{
    List<Path> files = new ArrayList<>();
    listFiles(rootDirectory, files);

    return files;
}

private static void listFiles(String path, List<Path> collectedFiles)
{
    File root = new File(path);
    File[] files = root.listFiles();

    if (files == null)
    {
        return;
    }

    for (File file : files)
    {
        if (file.isDirectory())
        {
            listFiles(file.getAbsolutePath(), collectedFiles);
        } else
        {
            collectedFiles.add(file.toPath());
        }
    }
}

具有单个列表的非递归BFS(特定的示例是搜索*。eml文件):

    final FileFilter filter = new FileFilter() {
        @Override
        public boolean accept(File file) {
            return file.isDirectory() || file.getName().endsWith(".eml");
        }
    };

    // BFS recursive search
    List<File> queue = new LinkedList<File>();
    queue.addAll(Arrays.asList(dir.listFiles(filter)));

    for (ListIterator<File> itr = queue.listIterator(); itr.hasNext();) {
        File file = itr.next();
        if (file.isDirectory()) {
            itr.remove();
            for (File f: file.listFiles(filter)) itr.add(f);
        }
    }

import java.io.File;

public class Main {
    public static void main(String[] args) {
        loopFiles(new File("C:\\Users\\serge.klimkovitch\\Documents"));
    }

    private static void loopFiles(File element) {
        if (element.isDirectory()) {
            for (File currentFile : element.listFiles()) {
                loopFiles(currentFile);
                System.out.println(currentFile);
            }
        }
    }
}