如果您试图简单地将两个存储库粘合在一起，那么子模块和子树合并是错误的工具，因为它们不能保留所有的文件历史记录（正如人们在其他答案中所指出的）。请参阅此处的答案，了解简单而正确的方法。

如果要将项目a合并到项目b中：

cd path/to/project-b
git remote add project-a /path/to/project-a
git fetch project-a --tags
git merge --allow-unrelated-histories project-a/master # or whichever branch you want to merge
git remote remove project-a

摘自：git合并不同的存储库？

这种方法对我来说效果很好，它更短，在我看来更干净。

如果您想将project-a放到子目录中，可以使用gitfilter repo（不建议使用过滤器分支）。在上述命令之前运行以下命令：

cd path/to/project-a
git filter-repo --to-subdirectory-filter project-a

合并两个大型存储库，将其中一个放在子目录中的示例：https://gist.github.com/x-yuri/9890ab1079cf4357d6f269d073fd9731

注意：--allow非相关历史参数仅在git>=2.9之后存在。请参阅Git-Git merge文档/-允许不相关的历史记录

更新：按照@jstadler的建议添加了--tags，以便保留标签。

除了使用远程add->fetch->merge策略的所有答案之外：如果您想保留其他存储库中的标记，但不想将它们全部泄漏到一个公共命名空间中（可能会发生冲突），您可能需要稍微更改fetch命令：

git fetch --no-tags other_repo
git fetch --no-tags other_repo 'refs/tags/*:refs/tags/other_repo/*'

第一个命令像往常一样获取所有分支，但省略了附加到提交的标记，第二个命令也省略了通常的标记获取机制（git help fetch了解更多信息），并使用git的refspec功能获取将它们从X映射到other_repo/X的所有标记。

引用（分支、标记）只是git中的文件，您可以使用目录来命名。上面的两个命令将保留第一个存储库中的标记，而另一个存储库的标记将以other_repo作为前缀/

操作完成后，最好移除另一个遥控器，这样您就不会意外地以正常方式获取标签并造成混乱。

如果您试图简单地将两个存储库粘合在一起，那么子模块和子树合并是错误的工具，因为它们不能保留所有的文件历史记录（正如人们在其他答案中所指出的）。请参阅此处的答案，了解简单而正确的方法。

我在使用merge时不断丢失历史记录，所以我最终使用了rebase，因为在我的情况下，两个存储库的不同程度足以避免每次提交时合并：

git clone git@gitorious/projA.git projA
git clone git@gitorious/projB.git projB

cd projB
git remote add projA ../projA/
git fetch projA 
git rebase projA/master HEAD

=>解决冲突，然后根据需要继续。。。

git rebase --continue

这样做会导致一个项目具有来自projA的所有提交，然后是来自projB的提交

此函数将远程repo克隆到本地repo目录中，合并后将保存所有提交，git日志将显示原始提交和正确路径：

function git-add-repo
{
    repo="$1"
    dir="$(echo "$2" | sed 's/\/$//')"
    path="$(pwd)"

    tmp="$(mktemp -d)"
    remote="$(echo "$tmp" | sed 's/\///g'| sed 's/\./_/g')"

    git clone "$repo" "$tmp"
    cd "$tmp"

    git filter-branch --index-filter '
        git ls-files -s |
        sed "s,\t,&'"$dir"'/," |
        GIT_INDEX_FILE="$GIT_INDEX_FILE.new" git update-index --index-info &&
        mv "$GIT_INDEX_FILE.new" "$GIT_INDEX_FILE"
    ' HEAD

    cd "$path"
    git remote add -f "$remote" "file://$tmp/.git"
    git pull "$remote/master"
    git merge --allow-unrelated-histories -m "Merge repo $repo into master" --edit "$remote/master"
    git remote remove "$remote"
    rm -rf "$tmp"
}

如何使用：

cd current/package
git-add-repo https://github.com/example/example dir/to/save

如果进行一些更改，您甚至可以将合并的repo的文件/目录移动到不同的路径中，例如：

repo="https://github.com/example/example"
path="$(pwd)"

tmp="$(mktemp -d)"
remote="$(echo "$tmp" | sed 's/\///g' | sed 's/\./_/g')"

git clone "$repo" "$tmp"
cd "$tmp"

GIT_ADD_STORED=""

function git-mv-store
{
    from="$(echo "$1" | sed 's/\./\\./')"
    to="$(echo "$2" | sed 's/\./\\./')"

    GIT_ADD_STORED+='s,\t'"$from"',\t'"$to"',;'
}

# NOTICE! This paths used for example! Use yours instead!
git-mv-store 'public/index.php' 'public/admin.php'
git-mv-store 'public/data' 'public/x/_data'
git-mv-store 'public/.htaccess' '.htaccess'
git-mv-store 'core/config' 'config/config'
git-mv-store 'core/defines.php' 'defines/defines.php'
git-mv-store 'README.md' 'doc/README.md'
git-mv-store '.gitignore' 'unneeded/.gitignore'

git filter-branch --index-filter '
    git ls-files -s |
    sed "'"$GIT_ADD_STORED"'" |
    GIT_INDEX_FILE="$GIT_INDEX_FILE.new" git update-index --index-info &&
    mv "$GIT_INDEX_FILE.new" "$GIT_INDEX_FILE"
' HEAD

GIT_ADD_STORED=""

cd "$path"
git remote add -f "$remote" "file://$tmp/.git"
git pull "$remote/master"
git merge --allow-unrelated-histories -m "Merge repo $repo into master" --edit "$remote/master"
git remote remove "$remote"
rm -rf "$tmp"

通知路径将通过sed替换，因此请确保在合并后将其移动到正确的路径中。--allow非相关历史参数仅在git>=2.9之后存在。