我在运行一个存储过程时遇到了这个问题——它正在数据库中的一个表中创建大量的行。 在超过30秒后，我就看到了这个错误。

我尝试了其他答案中的所有建议。我确信其中有一些帮助，然而，真正让我有用的是从Workbench切换到SequelPro。

我猜这是我在Workbench中没有发现的某个客户端连接。 也许这也能帮助到其他人?

只需执行一次MySQL升级，将重新构建innoDB引擎，并重新构建MySQL正常运行所需的许多表，如performance_schema, information_schema等。

从你的shell中发出下面的命令:

sudo mysql_upgrade -u root -p

这通常意味着你有“与当前版本的MySQL服务器不兼容”，参见mysql_upgrade。我也遇到了同样的问题，我不得不跑掉:

mysql_upgrade——密码 文档声明，“mysql_upgrade应该在每次升级MySQL时执行”。

进入工作台编辑→首选项→SQL编辑器→DBMS连接读取超时时间:高达3000。 错误不再发生。

新版本的MySQL WorkBench有一个选项可以更改特定的超时时间。

对我来说，它是在编辑→首选项→SQL编辑器→DBMS连接读取超时时间(秒):600

将值更改为6000。

此外，不勾选限制行，因为每次我想搜索整个数据集时都要设置一个限制，这会让人感到厌烦。

我也遇到过同样的问题。我相信当您有较大表的外键时(这需要时间)就会发生这种情况。

我尝试运行create table语句再次没有外键声明，并发现它工作。

然后在创建表之后，我使用ALTER table查询添加外键约束。

希望这能帮助到一些人。