使用plt.show(block=False)，并在脚本的末尾调用plt.show()。

这将确保脚本完成时窗口不会关闭。

您可能需要阅读matplotlib文档中的这个文档，标题为:

在python shell中使用matplotlib

在我的系统上，show()没有阻塞，尽管我希望脚本在继续之前等待用户与图形交互(并使用'pick_event'回调来收集数据)。

为了阻止执行直到绘图窗口关闭，我使用了以下方法:

fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(1,1,1)
ax.plot(x,y)

# set processing to continue when window closed
def onclose(event):
    fig.canvas.stop_event_loop()
fig.canvas.mpl_connect('close_event', onclose)

fig.show() # this call does not block on my system
fig.canvas.start_event_loop_default() # block here until window closed

# continue with further processing, perhaps using result from callbacks

但是请注意，canvas.start_event_loop_default()产生了以下警告:

C:\Python26\lib\site-packages\matplotlib\backend_bases.py:2051: DeprecationWarning: Using default event loop until function specific to this GUI is implemented
  warnings.warn(str,DeprecationWarning)

尽管脚本仍然在运行。

重要提示:只是为了澄清一些事情。我假设命令在.py脚本中，脚本是使用python script.py从控制台调用的。

对我来说，一个简单的方法是:

使用block = False在里面显示:plt。show(block = False) 在.py脚本的末尾使用另一个show()。

script.py文件示例:

plt.imshow(*something*)                                                               
plt.colorbar()                                                                             
plt.xlabel("true ")                                                                   
plt.ylabel("predicted ")                                                              
plt.title(" the matrix")  

# Add block = False                                           
plt.show(block = False)

################################
# OTHER CALCULATIONS AND CODE HERE ! ! !
################################

# the next command is the last line of my script
plt.show()

plt.figure(1)
plt.imshow(your_first_image)

plt.figure(2)
plt.imshow(your_second_image)

plt.show(block=False) # That's important 

raw_input("Press ENTER to exist") # Useful when you run your Python script from the terminal and you want to hold the running to see your figures until you press Enter

我还必须在我的代码中添加plt.pause(0.001)，以真正使它在for循环中工作(否则它只会显示第一个和最后一个plot):

import matplotlib.pyplot as plt

plt.scatter([0], [1])
plt.draw()
plt.show(block=False)

for i in range(10):
    plt.scatter([i], [i+1])
    plt.draw()
    plt.pause(0.001)