给定一个包含“BoolCol”列的DataFrame,我们希望找到其中“BoolCol”值== True的DataFrame的索引

我目前有迭代的方式来做到这一点,这是完美的:

for i in range(100,3000):
    if df.iloc[i]['BoolCol']== True:
         print i,df.iloc[i]['BoolCol']

但这不是熊猫的正确做法。经过一些研究,我目前正在使用以下代码:

df[df['BoolCol'] == True].index.tolist()

这一个给了我一个索引列表,但它们不匹配,当我检查它们时,我这样做:

df.iloc[i]['BoolCol']

结果实际上是假的!!

熊猫的正确做法是什么?


当前回答

如果你只想使用你的dataframe对象一次,使用:

df['BoolCol'].loc[lambda x: x==True].index

其他回答

另一种方法是使用pipe()对BoolCol的索引进行管道索引。就性能而言,它与使用[].1的规范索引一样高效

df['BoolCol'].pipe(lambda x: x.index[x])

如果BoolCol实际上是多个比较的结果,并且您希望使用方法链接将所有方法放在一个管道中,这尤其有用。

例如,如果你想获得NumCol值大于0.5、BoolCol值为True且NumCol值和BoolCol值的乘积大于0的行索引,你可以通过eval()对表达式求值并对结果调用pipe()来执行索引

df.eval("NumCol > 0.5 and BoolCol and NumCol * BoolCol >0").pipe(lambda x: x.index[x])


1:下面的基准测试使用了一个有20mil行的数据帧(平均过滤了一半的行),并检索了它们的索引。与其他有效的选项相比,通过pipe()进行链接的方法做得非常好。

n = 20_000_000
df = pd.DataFrame({'NumCol': np.random.rand(n).astype('float16'), 
                   'BoolCol': np.random.default_rng().choice([True, False], size=n)})

%timeit df.index[df['BoolCol']]
# 181 ms ± 2.47 ms per loop (mean ± std. dev. of 10 runs, 1000 loops each)

%timeit df['BoolCol'].pipe(lambda x: x.index[x])
# 181 ms ± 1.08 ms per loop (mean ± std. dev. of 10 runs, 1000 loops each)

%timeit df['BoolCol'].loc[lambda x: x].index
# 297 ms ± 7.15 ms per loop (mean ± std. dev. of 10 runs, 1000 loops each)

2:对于一个20 mil的行数据帧,以与1)相同的方式构建基准,你会发现这里提出的方法是最快的选择。它比位操作符链执行得更好,因为根据设计,eval()在一个大数据帧上执行多个操作的速度比向量化的Python操作快,而且它比query()更节省内存,因为与query()不同,eval().pipe(…)不需要创建一个切片数据帧的副本来获得它的索引。

可以使用numpy where()函数完成:

import pandas as pd
import numpy as np

In [716]: df = pd.DataFrame({"gene_name": ['SLC45A1', 'NECAP2', 'CLIC4', 'ADC', 'AGBL4'] , "BoolCol": [False, True, False, True, True] },
       index=list("abcde"))

In [717]: df
Out[717]: 
  BoolCol gene_name
a   False   SLC45A1
b    True    NECAP2
c   False     CLIC4
d    True       ADC
e    True     AGBL4

In [718]: np.where(df["BoolCol"] == True)
Out[718]: (array([1, 3, 4]),)

In [719]: select_indices = list(np.where(df["BoolCol"] == True)[0])

In [720]: df.iloc[select_indices]
Out[720]: 
  BoolCol gene_name
b    True    NECAP2
d    True       ADC
e    True     AGBL4

虽然你并不总是需要index来匹配,但如果你需要:

In [796]: df.iloc[select_indices].index
Out[796]: Index([u'b', u'd', u'e'], dtype='object')

In [797]: df.iloc[select_indices].index.tolist()
Out[797]: ['b', 'd', 'e']

df。Iloc [i]返回df的第i行。I不是指索引标签,I是一个基于0的索引。

相反,属性index返回实际的索引标签,而不是数字行索引:

df.index[df['BoolCol'] == True].tolist()

或者说,

df.index[df['BoolCol']].tolist()

通过使用DataFrame,你可以清楚地看到其中的区别 不等于该行数值位置的非默认索引:

df = pd.DataFrame({'BoolCol': [True, False, False, True, True]},
       index=[10,20,30,40,50])

In [53]: df
Out[53]: 
   BoolCol
10    True
20   False
30   False
40    True
50    True

[5 rows x 1 columns]

In [54]: df.index[df['BoolCol']].tolist()
Out[54]: [10, 40, 50]

如果你想使用索引,

In [56]: idx = df.index[df['BoolCol']]

In [57]: idx
Out[57]: Int64Index([10, 40, 50], dtype='int64')

然后你可以使用loc而不是iloc来选择行:

In [58]: df.loc[idx]
Out[58]: 
   BoolCol
10    True
40    True
50    True

[3 rows x 1 columns]

注意,loc也可以接受布尔数组:

In [55]: df.loc[df['BoolCol']]
Out[55]: 
   BoolCol
10    True
40    True
50    True

[3 rows x 1 columns]

如果你有一个布尔数组,掩码,并且需要序号索引值,你可以使用np.flatnonzero来计算它们:

In [110]: np.flatnonzero(df['BoolCol'])
Out[112]: array([0, 3, 4])

使用df。Iloc按序号索引选择行:

In [113]: df.iloc[np.flatnonzero(df['BoolCol'])]
Out[113]: 
   BoolCol
10    True
40    True
50    True

如果你只想使用你的dataframe对象一次,使用:

df['BoolCol'].loc[lambda x: x==True].index

简单的方法是在过滤之前重置DataFrame的索引:

df_reset = df.reset_index()
df_reset[df_reset['BoolCol']].index.tolist()

有点俗气,但是很快!