Delete .idea folder 
Close project ->
Reopen Project ->
Invalidate Caches / restart

我也遇到了同样的错误，每次我盯着Android Studio时都会看到警报，这真是太烦人了。我尝试了上面提到的解决方案，包括无效缓存，重新启动等，没有什么让它消失。

在我的例子中，我们从源代码中删除了一个模块，引用也从settings.gradle中删除了。结果，.idea/modules.xml仍然引用该模块。

我所需要做的就是从。idea/modules.xml中的<modules>中删除这一行，它使它全部消失。

对于windows用户，这也可能是由文件系统损坏引起的。

如果以上所有步骤都没有纠正错误:

关闭Android Studio 以管理员身份打开命令提示符 在存储应用程序的驱动器上运行chkdsk /f 删除。idea文件夹 重启Android Studio

首先，你应该更新到Android Studio 1.2 来源:https://code.google.com/p/android/issues/detail?id=77983

然后你应该去文件->无效缓存/重新启动->无效缓存&重新启动。

然后再次尝试构建应用程序。

您可以通过以下流程解决:

在Android Studio中，到左边面板，从Android切换到Project面板 展开。idea文件夹，可以看到modules.xml并打开文件。 在modules.xml文件中，你可能会看到如下内容:

  <component name="...">
    <modules>
      <module fileurl="file://$PROJECT_DIR$/[check...].iml" filepath="$PROJECT_DIR$/[check...].iml" group="myProject" />
      <module fileurl="file://$PROJECT_DIR$/app/[check...]-app.iml" filepath="$PROJECT_DIR$/app/[check...]-app.iml" group="[check...]/app" />

检查模块元素中的模块名称是否正确匹配 然后，同步gradle文件

以上所有答案都是正确的，但在我的情况下，我的应用程序目录中没有lib文件夹，我试图在应用程序gradle文件中调用下面的行

 compile fileTree(include: ['*.jar'], dir: 'libs')

所以要确保你在gradle文件中声明的任何依赖都对app可用