你可以使用DocToc从命令行生成目录:

doctoc /path/to/file

要使链接与Bitbucket生成的锚点兼容，请使用——Bitbucket参数运行它。

我只是开始做同样的事情(在Markdown做笔记)。我使用Sublime Text 2和MarkdownPreview插件。内置markdown解析器支持[TOC]。

我不确定，markdown的官方文件是什么? 交叉引用可以只用括号[Heading]，也可以用空括号[Heading][]。

两者都使用pandoc进行工作。 所以我创建了一个快速bash脚本，它将用其TOC替换md文件中的$__TOC__。(你需要envsubst，它可能不是你发行版的一部分)

#!/bin/bash
filename=$1
__TOC__=$(grep "^##" $filename | sed -e 's/ /1. /;s/^##//;s/#/   /g;s/\. \(.*\)$/. [\1][]/')
export __TOC__
envsubst '$__TOC__' < $filename

在Gitlab上，marklab支持这个:[[_TOC_]

MultiMarkdown Composer似乎生成了一个目录来辅助编辑。

也可能存在这样或那样的库，它们可以生成TOC:参见Python Markdown TOC扩展。

这是一个简短的PHP代码，我用来生成TOC，并丰富任何标题与锚:

$toc = []; //initialize the toc to an empty array
$markdown = "... your mardown content here...";

$markdown = preg_replace_callback("/(#+)\s*([^\n]+)/",function($matches) use (&$toc){
    static $section = [];
    $h = strlen($matches[1]);

    @$section[$h-1]++;
    $i = $h;
    while(isset($section[$i])) unset($section[$i++]);

    $anchor = preg_replace('/\s+/','-', strtolower(trim($matches[2])));

    $toc[] = str_repeat('  ',$h-1)."* [".implode('.',$section).". {$matches[2]}](#$anchor)";
    return str_repeat('#',$h)." <strong>".implode('.',$section).".</strong> ".$matches[2]."\n<a name=\"$anchor\"></a>\n";
}, $markdown);

然后你可以打印经过处理的markdown和toc:

   print(implode("\n",$toc));
   print("\n\n");
   print($markdown);