我喜欢Open DBDiff。

虽然它不是最完整的工具，但它工作得很好，它是免费的，而且非常容易使用。

试试DBComparer吧，它免费且快速:

http://dbcomparer.com/

来自http://www.simego.com/Products/SQL-Admin-Studio的SQL Admin Studio现在是免费的，可以让你管理你的SQL数据库，SQL比较和同步，数据比较和同步等等。也支持SQL Azure和一些MySQL支持太。

[更新:是的，我是上述程序的作者，因为它现在是免费的，我只是想与社区分享它]

我尝试了OpenDiff工具。伟大的工具是免费的，易于使用。

如果你使用MSSQL，我肯定会使用AdeptSQL。它是我用过的最不好看的数据库比较工具，但却是最有天赋的。它可以比较结构和数据。它告诉您哪些表在一个db上存在，而在另一个db上不存在，比较常用数据库的结构和数据，并生成脚本来同步这两个数据库。它不是免费的，但有30天的试用期(据我所知)

我以前用过SQL Delta (http://www.sqldelta.com/)，它真的很好。不过不是免费的，不知道价格如何与Red-Gates相比